OpenSlide Python 技术文档
2024-12-26 10:36:47作者:胡易黎Nicole
一、安装指南
1. 环境要求
在使用 OpenSlide Python 前,需要确保以下环境已经安装:
- Python 3.8 或以上版本
- OpenSlide 3.4.0 或以上版本
- Pillow 库
2. 安装方法
可以使用 pip 命令直接从 PyPI 安装 OpenSlide Python 及其依赖:
pip install openslide-python openslide-bin
如果需要自定义安装路径或其他安装选项,请参考 OpenSlide Python 安装文档。
二、项目使用说明
OpenSlide Python 是一个用于访问 OpenSlide 库的 Python 接口。OpenSlide 是一个 C 库,用于读取全切片图像,也称为虚拟切片。这些图像通常具有非常高的分辨率,未压缩时可能占用数十 GB 的空间。OpenSlide 允许在接近所需缩放级别的分辨率下读取少量图像数据。
OpenSlide 支持以下格式的虚拟切片:
- Aperio (
.svs
,.tif
) - DICOM (
.dcm
) - Hamamatsu (
.ndpi
,.vms
,.vmu
) - Leica (
.scn
) - MIRAX (
.mrxs
) - Philips (
.tiff
) - Sakura (
.svslide
) - Trestle (
.tif
) - Ventana (
.bif
,.tif
) - Zeiss (
.czi
) - 通用平铺 TIFF (
.tif
)
三、项目API使用文档
OpenSlide Python 的 API 文档详细介绍了如何使用该库。文档中包含了类的定义、方法、属性以及示例代码。请参考 OpenSlide Python API 文档 以获取更多信息。
四、项目安装方式
OpenSlide Python 的安装方式已在本文档的“一、安装指南”部分详细说明。简要概括如下:
- 确保环境要求已满足
- 使用 pip 命令安装 OpenSlide Python 及其依赖
pip install openslide-python openslide-bin
如需进一步自定义安装,请参考 OpenSlide Python 安装文档。
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