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OpenSlide Python 技术文档

2024-12-26 10:36:47作者:胡易黎Nicole

一、安装指南

1. 环境要求

在使用 OpenSlide Python 前,需要确保以下环境已经安装:

  • Python 3.8 或以上版本
  • OpenSlide 3.4.0 或以上版本
  • Pillow 库

2. 安装方法

可以使用 pip 命令直接从 PyPI 安装 OpenSlide Python 及其依赖:

pip install openslide-python openslide-bin

如果需要自定义安装路径或其他安装选项,请参考 OpenSlide Python 安装文档

二、项目使用说明

OpenSlide Python 是一个用于访问 OpenSlide 库的 Python 接口。OpenSlide 是一个 C 库,用于读取全切片图像,也称为虚拟切片。这些图像通常具有非常高的分辨率,未压缩时可能占用数十 GB 的空间。OpenSlide 允许在接近所需缩放级别的分辨率下读取少量图像数据。

OpenSlide 支持以下格式的虚拟切片:

  • Aperio (.svs, .tif)
  • DICOM (.dcm)
  • Hamamatsu (.ndpi, .vms, .vmu)
  • Leica (.scn)
  • MIRAX (.mrxs)
  • Philips (.tiff)
  • Sakura (.svslide)
  • Trestle (.tif)
  • Ventana (.bif, .tif)
  • Zeiss (.czi)
  • 通用平铺 TIFF (.tif)

三、项目API使用文档

OpenSlide Python 的 API 文档详细介绍了如何使用该库。文档中包含了类的定义、方法、属性以及示例代码。请参考 OpenSlide Python API 文档 以获取更多信息。

四、项目安装方式

OpenSlide Python 的安装方式已在本文档的“一、安装指南”部分详细说明。简要概括如下:

  • 确保环境要求已满足
  • 使用 pip 命令安装 OpenSlide Python 及其依赖
pip install openslide-python openslide-bin

如需进一步自定义安装,请参考 OpenSlide Python 安装文档

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