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pyGAM 使用教程

2024-09-13 07:33:26作者:董斯意

1. 项目介绍

pyGAM 是一个用于构建广义加性模型(Generalized Additive Models, GAMs)的 Python 包。GAMs 是广义线性模型(GLMs)的扩展,允许特征的非线性函数,同时保持模型的可加性。pyGAM 提供了灵活的 API,使得用户可以轻松地构建和调整 GAM 模型,适用于回归、分类等多种任务。

2. 项目快速启动

安装

首先,确保你已经安装了 Python 3.8 或更高版本。然后,使用 pip 安装 pyGAM:

pip install pygam

快速示例

以下是一个简单的回归示例,展示了如何使用 pyGAM 进行模型拟合和预测。

import numpy as np
from pygam import LinearGAM

# 生成一些示例数据
np.random.seed(0)
X = np.random.rand(100, 2)
y = 2 * X[:, 0] + 3 * X[:, 1] + np.random.randn(100)

# 创建并拟合模型
gam = LinearGAM().fit(X, y)

# 预测
X_test = np.random.rand(10, 2)
y_pred = gam.predict(X_test)

print("预测结果:", y_pred)

3. 应用案例和最佳实践

分类案例

pyGAM 不仅可以用于回归任务,还可以用于分类任务。以下是一个使用 LogisticGAM 进行二分类的示例。

from pygam import LogisticGAM
from sklearn.datasets import load_breast_cancer

# 加载乳腺癌数据集
data = load_breast_cancer()
X = data.data
y = data.target

# 创建并拟合模型
gam = LogisticGAM().fit(X, y)

# 预测
y_pred = gam.predict(X)

print("预测准确率:", gam.accuracy(X, y))

最佳实践

  1. 特征选择:在构建 GAM 模型时,选择合适的特征非常重要。可以使用部分依赖图(Partial Dependency Plots)来可视化特征与目标变量之间的关系。
  2. 模型调参:使用网格搜索(Grid Search)来自动调整模型参数,如 n_splineslam
  3. 模型解释:GAM 模型的可加性使得模型解释变得相对简单,可以通过查看每个特征的平滑函数来理解特征对目标变量的影响。

4. 典型生态项目

pyGAM 可以与其他 Python 数据科学工具包无缝集成,例如:

  • scikit-learn:用于数据预处理、模型评估和交叉验证。
  • pandas:用于数据处理和分析。
  • matplotlib 和 seaborn:用于数据可视化。

通过这些工具的结合,可以构建一个完整的数据分析和建模流程。

import pandas as pd
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.metrics import accuracy_score

# 加载数据集
df = pd.DataFrame(data.data, columns=data.feature_names)
df['target'] = data.target

# 分割数据集
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(df.drop('target', axis=1), df['target'], test_size=0.2, random_state=0)

# 创建并拟合模型
gam = LogisticGAM().fit(X_train, y_train)

# 预测
y_pred = gam.predict(X_test)

print("测试集准确率:", accuracy_score(y_test, y_pred))

通过以上步骤,你可以快速上手使用 pyGAM 进行数据建模和分析。

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