ESM-2 模型文档(中文)
2026-02-05 05:21:05作者:牧宁李
1. 模型概述
1.1 架构特点
2. 快速开始
2.1 环境配置
...
格式要求包括:
- 使用UTF-8无BOM编码
- 代码块保留原格式,仅添加行内注释翻译
- 表格采用**多语言对照格式**(示例如下)
| 参数名称 | 英文描述 | 中文描述 | 取值范围 |
|----------|----------|----------|----------|
| pad_token_id | Token id for padding | 填充令牌编号 | 整数,默认为1 |
| hidden_act | Activation function for hidden layers | 隐藏层激活函数 | gelu/relu/swish |
### 必备工具链安装
贡献者需配置以下工具环境:
```bash
# 克隆翻译专用仓库
git clone https://gitcode.com/hf_mirrors/facebook/esm2_t33_650M_UR50D.git
cd esm2_t33_650M_UR50D
# 安装翻译校验工具
pip install translate-toolkit==3.8.4 sphinx-intl==2.1.0
# 初始化语言环境(以中文为例)
sphinx-intl update -p _build/gettext -l zh_CN
核心校验命令:
tx check:术语一致性检查sphinx-build -b html . _build/html/zh_CN:本地预览python scripts/validate_json.py --lang zh:配置文件翻译校验
翻译流程与质量控制
五步翻译工作流
采用分支并行-定期合并的开发模式,完整流程如下:
flowchart TD
A[认领任务] --> B[创建翻译分支]
B --> C[文档翻译]
C --> D[自动化校验]
D --> E{通过?}
E -->|是| F[提交PR]
E -->|否| C
F --> G[审核委员会评审]
G --> H[合并主分支]
H --> I[生成多语言文档]
关键时间节点控制:
- 单章节翻译周期 ≤ 72小时
- 校验反馈响应 ≤ 24小时
- 版本合并窗口:每周六00:00-06:00(UTC+0)
质量评估矩阵
翻译质量通过三维度评估:
| 评估维度 | 权重 | 检查项 | 自动化工具 |
|---|---|---|---|
| 术语准确性 | 40% | 专业术语匹配度、参数名称一致性 | tx check + 术语库比对 |
| 语法流畅度 | 30% | 语句通顺度、专业表达自然度 | LanguageTool + 人工抽样 |
| 技术完整性 | 30% | 代码示例可执行性、参数范围准确性 | pytest + 单元测试翻译用例 |
评分标准采用5分制,单项低于3分的PR将被打回修改。社区将每月公示质量排名,前10%贡献者可获得模型优先体验资格。
冲突解决机制
当不同译者对同一内容产生翻译分歧时,执行以下步骤:
- 在PR评论区标注冲突段落,引用翻译指南相关条款
- 发起为期48小时的社区投票,每位活跃贡献者拥有1票权重
- 若投票未达成共识,提交技术委员会仲裁(由3位领域专家组成)
- 最终结果将更新至冲突案例库,作为后续翻译参考
典型冲突场景及解决方案:
- 术语选择冲突:以UniProt数据库的多语言版本为仲裁依据
- 句式结构冲突:优先采用符合学术写作规范的表达(如被动语态在实验步骤描述中的使用)
- 功能描述冲突:需同步修改对应语言的tokenizer_config.json注释并保持逻辑一致
文档类型与翻译要点
API参考文档
模型配置文件config.json包含29个核心参数,翻译时需注意:
- 数值型参数保留原格式,如
"hidden_size": 1280不可本地化 - 布尔型参数添加场景说明,如
"token_dropout": true译为"启用令牌dropout:训练时随机丢弃输入序列中的部分令牌以增强鲁棒性" - 枚举型参数需列出所有可能值,如
"hidden_act": "gelu"应说明"激活函数:支持gelu/relu/swish三种选项"
API文档采用参数卡片格式,示例:
hidden_dropout_prob
英文描述:Dropout probability for hidden layers
中文描述:隐藏层 dropout概率
取值范围:0.0-0.5(建议微调任务使用0.1-0.3)
相关影响:值越高模型泛化能力越强,但可能导致欠拟合
代码示例:
model = EsmForMaskedLM.from_pretrained( "facebook/esm2_t33_650M_UR50D", hidden_dropout_prob=0.2 # 对罕见氨基酸序列分析时建议提高至0.3 )
令牌系统说明
分词器配置文件tokenizer_config.json和special_tokens_map.json定义了模型的文本处理规则。翻译重点包括:
- 特殊令牌功能说明:如
<mask>(掩码令牌)在蛋白质序列预测中的作用 - 令牌ID映射关系:制作"ID-令牌-描述"三列对照表
- 序列处理流程:使用流程图展示从原始氨基酸序列到模型输入张量的转换过程
特殊令牌翻译示例:
| 令牌符号 | 英文描述 | 中文描述 | 主要用途 |
|---|---|---|---|
<cls> |
Classification token | 分类令牌 | 序列级任务的特征提取 |
<eos> |
End-of-sequence token | 序列结束令牌 | 标记蛋白质序列的终止位置 |
<mask> |
Mask token | 掩码令牌 | 掩盖目标氨基酸进行预测训练 |
模型应用教程
应用教程翻译需遵循"问题-方案-扩展"三段式结构:
- 场景定义:明确具体研究问题(如"膜蛋白跨膜区域预测")
- 步骤拆解:提供本地化环境下的操作指令,如:
# 中文环境下安装依赖
pip install torch==1.13.1 biopython==1.81
# 加载模型(添加中文日志)
from transformers import EsmTokenizer, EsmForMaskedLM
tokenizer = EsmTokenizer.from_pretrained("./", local_files_only=True)
model = EsmForMaskedLM.from_pretrained("./", local_files_only=True)
print("模型加载完成,参数规模:6.5亿")
- 结果解读:提供多语言输出示例及生物意义解释
贡献者激励与社区建设
贡献等级与权益
贡献者等级体系基于翻译质量和数量综合评定:
| 等级 | 所需贡献 | 核心权益 | 专属标识 |
|---|---|---|---|
| 译者 | 完成1个章节翻译 | 文档署名权、社区论坛访问权限 | 📚 |
| 审校者 | 5个PR审核通过 | 翻译工具高级权限、月度技术会议参与资格 | 🔍 |
| 维护者 | 主导1种语言版本 | 模型早鸟测试资格、Meta AI合作研究推荐 | 🛠️ |
| 委员会 | 年度评选产生 | 战略决策投票权、学术论文致谢署名 | 🏅 |
社区交流渠道
- 翻译者矩阵:按语言分组的Discord频道(每日活跃时段:08:00-22:00 UTC+8)
- 双周工作坊:线上实战培训,重点解决术语统一和复杂句式翻译问题
- 年度峰会:评选"十佳翻译贡献者",颁发模型定制化纪念品
长期发展规划
翻译计划分为三个阶段推进:
timeline
title ESM-2文档多语言化路线图
2023 Q4 : 完成核心文档翻译(中、日、西、法、德、俄6种语言)
2024 Q1 : 上线自动化翻译校验平台,新增葡、阿、印地、韩4种语言
2024 Q2 : 发布多语言API文档生成工具,支持文档版本自动同步
2024 Q3 : 举办首届"蛋白质语言模型应用大赛"(多语言赛道)
登录后查看全文
热门项目推荐
相关项目推荐
Kimi-K2.5Kimi K2.5 是一款开源的原生多模态智能体模型,它在 Kimi-K2-Base 的基础上,通过对约 15 万亿混合视觉和文本 tokens 进行持续预训练构建而成。该模型将视觉与语言理解、高级智能体能力、即时模式与思考模式,以及对话式与智能体范式无缝融合。Python00- QQwen3-Coder-Next2026年2月4日,正式发布的Qwen3-Coder-Next,一款专为编码智能体和本地开发场景设计的开源语言模型。Python00
xw-cli实现国产算力大模型零门槛部署,一键跑通 Qwen、GLM-4.7、Minimax-2.1、DeepSeek-OCR 等模型Go06
PaddleOCR-VL-1.5PaddleOCR-VL-1.5 是 PaddleOCR-VL 的新一代进阶模型,在 OmniDocBench v1.5 上实现了 94.5% 的全新 state-of-the-art 准确率。 为了严格评估模型在真实物理畸变下的鲁棒性——包括扫描伪影、倾斜、扭曲、屏幕拍摄和光照变化——我们提出了 Real5-OmniDocBench 基准测试集。实验结果表明,该增强模型在新构建的基准测试集上达到了 SOTA 性能。此外,我们通过整合印章识别和文本检测识别(text spotting)任务扩展了模型的能力,同时保持 0.9B 的超紧凑 VLM 规模,具备高效率特性。Python00
KuiklyUI基于KMP技术的高性能、全平台开发框架,具备统一代码库、极致易用性和动态灵活性。 Provide a high-performance, full-platform development framework with unified codebase, ultimate ease of use, and dynamic flexibility. 注意:本仓库为Github仓库镜像,PR或Issue请移步至Github发起,感谢支持!Kotlin08
VLOOKVLOOK™ 是优雅好用的 Typora/Markdown 主题包和增强插件。 VLOOK™ is an elegant and practical THEME PACKAGE × ENHANCEMENT PLUGIN for Typora/Markdown.Less00
热门内容推荐
最新内容推荐
项目优选
收起
deepin linux kernel
C
27
11
OpenHarmony documentation | OpenHarmony开发者文档
Dockerfile
531
3.74 K
openEuler内核是openEuler操作系统的核心,既是系统性能与稳定性的基石,也是连接处理器、设备与服务的桥梁。
C
336
178
本项目是CANN提供的数学类基础计算算子库,实现网络在NPU上加速计算。
C++
886
596
Ascend Extension for PyTorch
Python
340
403
暂无简介
Dart
772
191
Nop Platform 2.0是基于可逆计算理论实现的采用面向语言编程范式的新一代低代码开发平台,包含基于全新原理从零开始研发的GraphQL引擎、ORM引擎、工作流引擎、报表引擎、规则引擎、批处理引引擎等完整设计。nop-entropy是它的后端部分,采用java语言实现,可选择集成Spring框架或者Quarkus框架。中小企业可以免费商用
Java
12
1
openJiuwen agent-studio提供零码、低码可视化开发和工作流编排,模型、知识库、插件等各资源管理能力
TSX
986
247
本仓将收集和展示高质量的仓颉示例代码,欢迎大家投稿,让全世界看到您的妙趣设计,也让更多人通过您的编码理解和喜爱仓颉语言。
Cangjie
416
4.21 K
React Native鸿蒙化仓库
JavaScript
303
355