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数据集元数据管理工具dataspice配置指南

2025-05-25 12:43:54作者:钟日瑜

1. 项目目录结构及介绍

dataspice 是一个R包,旨在帮助研究人员为他们的数据集创建基本、轻量级且简洁的元数据文件。以下是项目的目录结构及其介绍:

  • data/:存放示例数据集和元数据模板CSV文件。
  • example-dataset/:包含与包一起提供的示例数据文件。
  • .Rbuildignore:用于指定在构建R包时应该被忽略的文件和目录。
  • .gitignore:用于指定在git版本控制中应该被忽略的文件和目录。
  • DESCRIPTION:R包的描述文件,包含包的元数据。
  • LICENSE:许可文件,本项目采用MIT许可。
  • NAMESPACE:R包的命名空间文件,定义了包的API。
  • NEWS.md:记录包的更新历史。
  • README.Rmd:包含项目说明的Markdown文件,用于生成项目的README文件。
  • README.md:生成的README文件的Markdown版本。
  • cran-comments.md:用于CRAN提交的注释。
  • dataspice.Rproj:RStudio项目的文件。
  • dataspice.png:项目的图标文件。

2. 项目的启动文件介绍

dataspice 包的启动主要是通过R控制台或RStudio进行。首先,需要安装包:

install.packages("dataspice")

安装完成后,可以加载包并开始使用:

library(dataspice)

使用 create_spice() 函数创建元数据模板CSV文件:

create_spice()

这将默认在当前工作目录的 data/metadata 文件夹中创建以下四个CSV模板文件:

  • biblio.csv:用于标题、摘要、空间和时间覆盖等信息。
  • creators.csv:用于数据作者信息。
  • attributes.csv:用于解释数据集中的每个变量。
  • access.csv:用于文件、文件类型和下载URL(如果适用)。

3. 项目的配置文件介绍

配置文件主要是通过编辑上述CSV模板文件来完成的。以下是每个配置文件的简要介绍:

  • biblio.csv:此文件包含一行,描述数据集的整体信息,如标题、描述、发布日期、引用和关键词等。

  • creators.csv:此文件包含数据集作者的详细信息,如ID、姓名、所属机构和电子邮件地址。

  • attributes.csv:此文件包含数据集中的每个变量的详细信息,如变量名、描述和单位。

  • access.csv:此文件包含数据集中每个文件的详细信息,如文件名、文件类型和下载URL。

可以通过直接编辑CSV文件或在Shiny应用中编辑它们来完成配置。Shiny应用可以通过以下函数打开:

  • edit_attributes():编辑 attributes.csv
  • edit_access():编辑 access.csv
  • edit_creators():编辑 creators.csv
  • edit_biblio():编辑 biblio.csv

完成编辑后,可以使用 write_spice() 函数生成JSON-LD文件,以帮助数据集的发现和创建更详细的元数据格式。此外,build_site() 函数可以创建一个简单的HTML网页,展示数据集的元数据和交互式地图。

以上就是 dataspice 的配置指南,通过这些步骤,用户可以轻松地为自己的数据集创建和管理元数据。

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