scispacy 项目使用教程

1. 项目的目录结构及介绍

scispacy 项目的目录结构如下：

scispacy/
├── scispacy/
│   ├── __init__.py
│   ├── custom_tokenizer.py
│   ├── linker.py
│   ├── models.py
│   ├── pipeline.py
│   ├── util.py
│   └── ...
├── tests/
│   ├── __init__.py
│   ├── test_custom_tokenizer.py
│   ├── test_linker.py
│   ├── test_models.py
│   ├── test_pipeline.py
│   └── ...
├── setup.py
├── README.md
├── requirements.txt
└── ...

目录结构介绍

• scispacy/: 包含项目的主要代码文件。
  • __init__.py: 初始化文件。
  • custom_tokenizer.py: 自定义分词器。
  • linker.py: 实体链接模块。
  • models.py: 模型定义。
  • pipeline.py: 处理管道。
  • util.py: 工具函数。
• tests/: 包含项目的测试代码。
  • __init__.py: 初始化文件。
  • test_custom_tokenizer.py: 测试自定义分词器。
  • test_linker.py: 测试实体链接模块。
  • test_models.py: 测试模型定义。
  • test_pipeline.py: 测试处理管道。
• setup.py: 安装脚本。
• README.md: 项目说明文档。
• requirements.txt: 项目依赖文件。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件主要是 scispacy/__init__.py，该文件负责初始化项目并加载必要的模块和配置。

启动文件内容

from .pipeline import SciSpacyPipeline
from .models import load_model

__all__ = ["SciSpacyPipeline", "load_model"]

启动文件介绍

• SciSpacyPipeline: 处理管道类，负责处理输入文本。
• load_model: 加载模型的函数。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件主要是 setup.py 和 requirements.txt。

setup.py

setup.py 文件负责项目的安装和打包。

from setuptools import setup, find_packages

setup(
    name="scispacy",
    version="0.5.4",
    packages=find_packages(),
    install_requires=[
        "spacy>=3.0.0",
        "numpy",
        "scipy",
        "scikit-learn",
    ],
    author="Allen Institute for Artificial Intelligence",
    author_email="[e-mail]",
    description="A full spaCy pipeline and models for scientific/biomedical documents",
    long_description=open("README.md").read(),
    long_description_content_type="text/markdown",
    url="https://github.com/allenai/scispacy",
    classifiers=[
        "Programming Language :: Python :: 3",
        "License :: OSI Approved :: MIT License",
        "Operating System :: OS Independent",
    ],
    python_requires='>=3.6',
)

requirements.txt

requirements.txt 文件列出了项目依赖的库。

spacy>=3.0.0
numpy
scipy
scikit-learn

配置文件介绍

• setup.py: 包含项目的名称、版本、依赖、作者等信息。
• requirements.txt: 列出了项目运行所需的依赖库。

以上是 scispacy 项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些信息能帮助你更好地理解和使用该项目。