《molgenis开源项目启动与配置教程》
2025-05-14 02:18:23作者:明树来
1. 项目的目录结构及介绍
molgenis
是一个基于Java的开源生物信息学平台,用于快速构建生物信息学数据库和生物信息学工具。以下是项目的目录结构及其简要介绍:
molgenis/
├── api/ # 包含molgenis的API相关的代码和文档
├── core/ # 核心代码库,包括数据库交互、数据导入/导出等功能
├──/molgenis_apps/ # molgenis应用程序的目录
├──OMET/ # 包含molgenis的元数据模型编辑器工具
├── RooStarter/ # 使用Roo框架生成的启动类和配置文件
├── scripts/ # 脚本目录,包括数据库迁移脚本等
├── solr/ # Solr搜索引擎的配置文件和索引数据
├── src/ # 源代码目录,包括Java源文件和资源文件
├── test/ # 测试代码目录,包含单元测试和集成测试
├── webapp/ # Web应用程序的目录,包含JSP文件、CSS样式和JavaScript代码
├── README.md # 项目说明文件
├── .gitignore # 指定Git应该忽略的文件和目录
└── ... # 其他可能存在的目录或文件
2. 项目的启动文件介绍
molgenis
的启动主要通过 RooStarter
目录下的 RooShell
。以下是启动项目的步骤:
- 进入
RooStarter
目录。 - 执行
mvn clean install
命令来构建项目。 - 执行
java -jar target/molgenis*.jar
命令来启动molgenis应用程序。
此外,在 webapp/
目录下,通常会有一个 WEB-INF
目录,其中包含 web.xml
文件,这是部署到Java EE容器(如Tomcat)时的主要配置文件。
3. 项目的配置文件介绍
molgenis
的配置文件主要用于设置数据库连接、应用程序属性和Solr搜索引擎等。以下是一些主要的配置文件及其作用:
-
application.properties
:这个文件位于src/main/resources
目录下,用于配置应用程序的各种属性,如数据库连接信息、日志级别等。例如:
database.url=jdbc:mysql://localhost:3306/molgenis database.user=root database.password=mypassword
-
log4j.properties
:这个文件配置了日志记录的细节,包括日志级别和日志输出的目的地。 -
solrconfig.xml
:这个文件位于solr/
目录下,用于配置Solr搜索引擎的相关参数。 -
web.xml
:这个文件是Web应用的部署描述符,用于配置Web应用的servlets、filters、listener以及其它配置。
确保在启动项目之前正确配置这些文件,以避免启动和运行时出现错误。
登录后查看全文
热门项目推荐
cherry-studio
🍒 Cherry Studio 是一款支持多个 LLM 提供商的桌面客户端TypeScript038RuoYi-Vue3
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统Vue0410arkanalyzer
方舟分析器:面向ArkTS语言的静态程序分析框架TypeScript040GitCode百大开源项目
GitCode百大计划旨在表彰GitCode平台上积极推动项目社区化,拥有广泛影响力的G-Star项目,入选项目不仅代表了GitCode开源生态的蓬勃发展,也反映了当下开源行业的发展趋势。03CS-Books
🔥🔥超过1000本的计算机经典书籍、个人笔记资料以及本人在各平台发表文章中所涉及的资源等。书籍资源包括C/C++、Java、Python、Go语言、数据结构与算法、操作系统、后端架构、计算机系统知识、数据库、计算机网络、设计模式、前端、汇编以及校招社招各种面经~013openGauss-server
openGauss kernel ~ openGauss is an open source relational database management systemC++0145
热门内容推荐
1 freeCodeCamp JavaScript高阶函数中的对象引用陷阱解析2 freeCodeCamp全栈开发课程中测验游戏项目的参数顺序问题解析3 freeCodeCamp音乐播放器项目中的函数调用问题解析4 freeCodeCamp 课程中关于角色与职责描述的语法优化建议 5 freeCodeCamp博客页面工作坊中的断言方法优化建议6 freeCodeCamp猫照片应用教程中的HTML注释测试问题分析7 freeCodeCamp论坛排行榜项目中的错误日志规范要求8 freeCodeCamp英语课程视频测验选项与提示不匹配问题分析9 freeCodeCamp课程页面空白问题的技术分析与解决方案10 freeCodeCamp课程视频测验中的Tab键导航问题解析
最新内容推荐
Visual-RFT项目中模型路径差异的技术解析 Beyla项目中的HTTP2连接检测问题解析 Microcks在OpenShift上部署Keycloak PostgreSQL的权限问题解析 RaspberryMatic项目中HmIP-BWTH温控器假期模式设置问题分析 Lets-Plot 库中条形图标签在坐标轴反转时的定位问题解析 BedrockConnect项目版本兼容性问题解析与解决方案 LiquidJS 10.21.0版本新增数组过滤功能解析 Mink项目中Selenium驱动切换iframe的兼容性问题分析 Lichess移动端盲棋模式字符串优化解析 sbctl验证功能JSON输出问题解析
项目优选
收起

🔥LeetCode solutions in any programming language | 多种编程语言实现 LeetCode、《剑指 Offer(第 2 版)》、《程序员面试金典(第 6 版)》题解
Java
51
15

🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
566
410

React Native鸿蒙化仓库
C++
124
208

openGauss kernel ~ openGauss is an open source relational database management system
C++
75
145

🍒 Cherry Studio 是一款支持多个 LLM 提供商的桌面客户端
TypeScript
428
38

前端智能化场景解决方案UI库,轻松构建你的AI应用,我们将持续完善更新,欢迎你的使用与建议。
官网地址:https://matechat.gitcode.com
693
91

旨在打造算法先进、性能卓越、高效敏捷、安全可靠的密码套件,通过轻量级、可剪裁的软件技术架构满足各行业不同场景的多样化要求,让密码技术应用更简单,同时探索后量子等先进算法创新实践,构建密码前沿技术底座!
C
98
253

本仓将收集和展示高质量的仓颉示例代码,欢迎大家投稿,让全世界看到您的妙趣设计,也让更多人通过您的编码理解和喜爱仓颉语言。
Cangjie
298
1.03 K

Dora SSR 是一款跨平台的游戏引擎,提供前沿或是具有探索性的游戏开发功能。它内置了Web IDE,提供了可以轻轻松松通过浏览器访问的快捷游戏开发环境,特别适合于在新兴市场如国产游戏掌机和其它移动电子设备上直接进行游戏开发和编程学习。
C++
20
4

🔥🔥超过1000本的计算机经典书籍、个人笔记资料以及本人在各平台发表文章中所涉及的资源等。书籍资源包括C/C++、Java、Python、Go语言、数据结构与算法、操作系统、后端架构、计算机系统知识、数据库、计算机网络、设计模式、前端、汇编以及校招社招各种面经~
98
13