Kubegene 开源项目启动与配置教程

1. 项目目录结构及介绍

Kubegene 是一个基于 Kubernetes 的基因分析工作流管理系统。以下是项目的目录结构及其简要介绍：

• docs/：存放项目的文档。
• example/：包含一些示例配置文件和启动脚本。
• hack/：包含一些辅助脚本，用于项目的构建、测试和部署。
• images/：存放项目所需的 Docker 镜像。
• kubegene/：项目的核心代码，包括 API 定义、控制器逻辑等。
• pkg/：包含一些公共库和工具。
• test/：存放单元测试和集成测试代码。
• webhook/：用于处理外部请求的 webhook 逻辑。
• Makefile：构建和部署项目的主要脚本。
• README.md：项目的说明文档。
• go.mod：Go 项目的依赖管理文件。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件主要是 example/ 目录下的 start-kubegene.sh 脚本。以下是启动文件的主要内容：

#!/bin/bash

# 设置命名空间
NAMESPACE=kubegene

# 创建命名空间
kubectl create ns ${NAMESPACE}

# 部署 CRD
kubectl apply -f example/crd.yaml

# 部署控制器和 webhook
kubectl apply -f example/deployment.yaml

# 部署配置文件
kubectl apply -f example/configmap.yaml

echo "Kubegene has been started successfully."

该脚本会执行以下步骤：

1. 设置命名空间变量。
2. 创建命名空间。
3. 应用 Custom Resource Definitions (CRD)。
4. 部署控制器和 webhook。
5. 部署配置文件。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件主要是 example/configmap.yaml。以下是配置文件的主要内容：

apiVersion: v1
kind: ConfigMap
metadata:
  name: kubegene-config
  namespace: kubegene
data:
  # 配置参数
  config: |
    # 在这里定义配置参数
    geneAnalysis:
      image: kubegene/gene-analysis:latest
      resources:
        requests:
          cpu: "1"
          memory: "2Gi"
        limits:
          cpu: "2"
          memory: "4Gi"

配置文件定义了以下内容：

• configMap 的名称和命名空间。
• data 字段下的 config 键包含项目所需的配置参数，例如基因分析任务的 Docker 镜像、资源请求和限制等。

确保在使用前根据实际需求修改配置参数。