首页
/ 【亲测免费】 开源项目推荐:vg

【亲测免费】 开源项目推荐:vg

2026-01-29 12:46:05作者:郁楠烈Hubert

项目基础介绍和主要编程语言

vg 是一个用于处理基因组变异图的开源工具集,主要用于基因组数据的变异图构建、对齐、基因分型和变异调用。该项目由vgteam开发,主要使用C++语言编写,同时也包含一些Python和Shell脚本。

项目核心功能

vg的核心功能包括:

  1. 变异图数据结构:提供了一种简洁的基因组序列编码方式,通过节点和边来表示基因组中的变异。
  2. 路径描述:支持将基因组、序列对齐和注释(如基因模型和转录本)表示为通过节点和边的路径。
  3. 坐标系统:路径提供了相对于基因组的坐标系统,即使在图结构发生变化时,也能保持稳定的映射。
  4. 工具集:包含多种工具,用于图的构建、转换、对齐、基因分型和变异调用等操作。

项目最近更新的功能

vg项目最近更新的功能包括:

  1. 支持ARM架构:在Mac平台上,vg现在支持ARM架构,特别是Apple的M1、M1 Pro、M1 Max等芯片设计。
  2. 改进的构建流程:优化了在Linux和MacOS上的构建流程,特别是对于依赖项的安装和配置进行了改进。
  3. 增强的文档和测试:增加了更多的文档示例和测试用例,以帮助开发者更好地理解和使用vg工具集。
  4. 性能优化:对核心算法进行了性能优化,提高了图构建和对齐的速度。

通过这些更新,vg项目在基因组数据处理和分析方面提供了更强大的功能和更好的用户体验。

登录后查看全文

项目优选

收起
kernelkernel
deepin linux kernel
C
27
11
docsdocs
OpenHarmony documentation | OpenHarmony开发者文档
Dockerfile
514
3.69 K
ops-mathops-math
本项目是CANN提供的数学类基础计算算子库,实现网络在NPU上加速计算。
C++
873
538
pytorchpytorch
Ascend Extension for PyTorch
Python
316
360
kernelkernel
openEuler内核是openEuler操作系统的核心,既是系统性能与稳定性的基石,也是连接处理器、设备与服务的桥梁。
C
333
152
RuoYi-Vue3RuoYi-Vue3
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
1.31 K
732
flutter_flutterflutter_flutter
暂无简介
Dart
757
182
nop-entropynop-entropy
Nop Platform 2.0是基于可逆计算理论实现的采用面向语言编程范式的新一代低代码开发平台,包含基于全新原理从零开始研发的GraphQL引擎、ORM引擎、工作流引擎、报表引擎、规则引擎、批处理引引擎等完整设计。nop-entropy是它的后端部分,采用java语言实现,可选择集成Spring框架或者Quarkus框架。中小企业可以免费商用
Java
12
1
leetcodeleetcode
🔥LeetCode solutions in any programming language | 多种编程语言实现 LeetCode、《剑指 Offer(第 2 版)》、《程序员面试金典(第 6 版)》题解
Java
67
20
openHiTLSopenHiTLS
旨在打造算法先进、性能卓越、高效敏捷、安全可靠的密码套件,通过轻量级、可剪裁的软件技术架构满足各行业不同场景的多样化要求,让密码技术应用更简单,同时探索后量子等先进算法创新实践,构建密码前沿技术底座!
C
1.05 K
519