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CNV检测工具cnvpytor脚本程序和结果合并python程序

2026-01-31 05:00:20作者:宣海椒Queenly

欢迎使用这款优秀的拷贝数变化(CNV)分析工具——cnvpytor。该工具是基于Python内核开发,旨在强化CNVnator的可视化、模块化、功能和计算能力,为研究人员提供更加便捷、高效的CNV和CNA分析解决方案。

工具描述

cnvpytor利用RD和BAF信息,可以更加准确地计算CNV和CNA。本仓库提供的资源文件包括以下内容:

  • cnvpytor.zip:包含cnvpytor脚本程序。
  • cnvpytor_merge.py:用于合并CNVpytor分析结果的Python程序。
  • cnvpytor_calling.sh:用于调用CNVpytor分析过程的shell脚本。

使用方法

  1. 下载并解压cnvpytor.zip文件。
  2. 将cnvpytor_merge.py和cnvpytor_calling.sh文件放在同一目录下。
  3. 根据需要修改cnvpytor_calling.sh脚本中的参数,例如输入文件路径、输出文件路径等。
  4. 运行cnvpytor_calling.sh脚本,开始CNV分析。
  5. 分析完成后,使用cnvpytor_merge.py合并结果。

注意事项

  • 请确保您的系统中已安装Python和shell环境。
  • 根据实际情况调整脚本中的参数,以获得最佳分析效果。

希望这款CNV检测工具能为您提供便利,助力您的研究工作。祝您使用愉快!

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