探索基因表达差异的奥秘:Differential Gene Expression Workshop
2024-05-20 19:40:30作者:蔡丛锟
在这个高度集成的信息时代,生物科学与计算技术的结合日益紧密,尤其是在基因研究领域。如果你对如何利用R语言进行差异基因表达(DGE)分析感兴趣,那么这个开源项目——Differential gene expression workshop 是你不能错过的宝贵资源。
1、项目介绍
这个项目由哈佛大学陈曾熙公共卫生学院生物信息学核心团队开发,是一个为期1.5天的工作坊,旨在引导参与者通过R/RStudio完成RNA-seq计数数据的DGE分析流程。即使你是R新手,只要你完成了基础的R入门课程,就可以参加。
2、项目技术分析
工作坊涵盖以下核心技术:
- 使用主成分分析(PCA)和层次聚类进行质量控制
- 利用DESeq2获取显著差异基因列表
- 可视化差异表达基因的表达模式
- 采用R内置工具进行功能基因分析
教程中的每个环节都经过精心设计,既适合在指导下进行,也适合自学。
3、项目及技术应用场景
无论是实验室的研究员、生物信息学家还是希望深入理解基因表达变化的生物学学生,都可以从这个项目中受益。这些技能广泛应用于RNA-seq实验结果解析、疾病机制探究以及药物靶点发现等领域。
4、项目特点
- 易上手:针对有初步R基础的学习者,提供了一条清晰的自我学习或培训路径。
- 实操性强:以实际案例为基础,引导学员动手操作,加深理解和记忆。
- 全面覆盖:不仅教授统计分析方法,还涉及结果解释和后续的功能分析。
- 开放共享:遵循创造性共同许可协议4.0版(CC BY 4.0),鼓励分享和再创造。
为了开始你的DGE分析之旅,请访问项目主页,按照指示安装所需软件包,并逐步探索每一个精彩的教学章节。准备好深入到基因表达的海洋中,发掘生命的密码吧!
登录后查看全文
热门项目推荐
Kimi-K2.5Kimi K2.5 是一款开源的原生多模态智能体模型,它在 Kimi-K2-Base 的基础上,通过对约 15 万亿混合视觉和文本 tokens 进行持续预训练构建而成。该模型将视觉与语言理解、高级智能体能力、即时模式与思考模式,以及对话式与智能体范式无缝融合。Python00- QQwen3-Coder-Next2026年2月4日,正式发布的Qwen3-Coder-Next,一款专为编码智能体和本地开发场景设计的开源语言模型。Python00
xw-cli实现国产算力大模型零门槛部署,一键跑通 Qwen、GLM-4.7、Minimax-2.1、DeepSeek-OCR 等模型Go06
PaddleOCR-VL-1.5PaddleOCR-VL-1.5 是 PaddleOCR-VL 的新一代进阶模型,在 OmniDocBench v1.5 上实现了 94.5% 的全新 state-of-the-art 准确率。 为了严格评估模型在真实物理畸变下的鲁棒性——包括扫描伪影、倾斜、扭曲、屏幕拍摄和光照变化——我们提出了 Real5-OmniDocBench 基准测试集。实验结果表明,该增强模型在新构建的基准测试集上达到了 SOTA 性能。此外,我们通过整合印章识别和文本检测识别(text spotting)任务扩展了模型的能力,同时保持 0.9B 的超紧凑 VLM 规模,具备高效率特性。Python00
Baichuan-M3-235BBaichuan-M3 是百川智能推出的新一代医疗增强型大型语言模型,是继 Baichuan-M2 之后的又一重要里程碑。Python00
VLOOKVLOOK™ 是优雅好用的 Typora/Markdown 主题包和增强插件。 VLOOK™ is an elegant and practical THEME PACKAGE × ENHANCEMENT PLUGIN for Typora/Markdown.Less00
热门内容推荐
最新内容推荐
Degrees of Lewdity中文汉化终极指南:零基础玩家必看的完整教程Unity游戏翻译神器:XUnity Auto Translator 完整使用指南PythonWin7终极指南:在Windows 7上轻松安装Python 3.9+终极macOS键盘定制指南:用Karabiner-Elements提升10倍效率Pandas数据分析实战指南:从零基础到数据处理高手 Qwen3-235B-FP8震撼升级:256K上下文+22B激活参数7步搞定机械键盘PCB设计:从零开始打造你的专属键盘终极WeMod专业版解锁指南:3步免费获取完整高级功能DeepSeek-R1-Distill-Qwen-32B技术揭秘:小模型如何实现大模型性能突破音频修复终极指南:让每一段受损声音重获新生
项目优选
收起
OpenHarmony documentation | OpenHarmony开发者文档
Dockerfile
539
3.76 K
Ascend Extension for PyTorch
Python
348
413
本项目是CANN提供的数学类基础计算算子库,实现网络在NPU上加速计算。
C++
889
609
openEuler内核是openEuler操作系统的核心,既是系统性能与稳定性的基石,也是连接处理器、设备与服务的桥梁。
C
338
185
暂无简介
Dart
778
193
deepin linux kernel
C
27
11
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
1.34 K
758
React Native鸿蒙化仓库
JavaScript
303
357
openJiuwen agent-studio提供零码、低码可视化开发和工作流编排,模型、知识库、插件等各资源管理能力
TSX
986
252
仓颉编译器源码及 cjdb 调试工具。
C++
154
896