首页
/ Nilearn 0.12.0版本发布:神经影像分析工具的重大更新

Nilearn 0.12.0版本发布:神经影像分析工具的重大更新

2025-07-03 23:40:19作者:瞿蔚英Wynne

Nilearn是一个基于Python的神经影像分析工具库,它构建在scikit-learn之上,专门用于处理和分析神经影像数据(如fMRI、MRI等)。该库提供了从预处理到统计分析和可视化的完整工作流,极大简化了神经影像研究的复杂性。

核心功能改进

1. 表面数据处理能力增强

新版本显著提升了处理表面数据(surface data)的能力,这是神经影像分析中的重要数据类型。主要改进包括:

  • 新增对表面图像阈值处理的支持,使研究人员能够更精确地控制统计显著性水平
  • 扩展了math_imgbinarize_img函数以支持表面数据,为数学运算提供了更多灵活性
  • 改进了high_variance_confounds函数对表面数据的兼容性,提升了数据预处理质量
  • 实现了表面数据的GLM(广义线性模型)结果保存功能,完善了分析流程

2. 图谱标准化与改进

图谱在神经影像研究中至关重要,新版本对图谱系统进行了多项优化:

  • 为确定性图谱添加了查找表功能,使区域识别更加直观
  • 改进了Yeo图谱的数据获取方式,提高了标准化程度
  • 扩展了表面标签掩码器(SurfaceLabelsMasker)的策略选项,增加了分析灵活性
  • 确保所有图谱都能被各种掩码器正确使用,提高了系统稳定性

技术架构优化

1. 绘图系统重构

绘图功能是Nilearn的重要组成部分,0.12.0版本进行了深度重构:

  • 将绘图功能按类型划分为surface、matrix等专门模块,提高了代码组织性
  • 分离了matplotlib和plotly的后端实现,为不同可视化需求提供了更多选择
  • 改进了透明度和覆盖图显示效果,使可视化结果更加专业
  • 新增了Bland-Altman图绘制功能,为方法比较提供了新工具

2. 估计器检查与验证

为确保分析质量,新版本强化了估计器检查机制:

  • 实现了全面的参数类型检查,防止无效输入导致错误
  • 增加了对估计器拟合前后参数一致性的验证
  • 完善了变换器检查机制,确保数据处理流程的可靠性
  • 添加了对空图像输入的检查,提高了鲁棒性

用户体验提升

1. 报告系统增强

报告功能让结果解释更加直观:

  • 为基于表面的GLM添加了报告生成功能
  • 改进了多运行GLM报告的用户体验
  • 使用pandas创建参数HTML表格,提升了报告可读性
  • 为无超阈值结果的情况添加了明确提示

2. 性能与兼容性

  • 引入了性能基准测试系统,便于监控关键功能的执行效率
  • 优化了大型fMRI图像的处理效率
  • 提高了与最新版scikit-learn的兼容性
  • 减少了不必要的警告信息,使输出更加清晰

总结

Nilearn 0.12.0版本通过增强表面数据处理能力、重构绘图系统、完善估计器验证机制和提升报告功能,为神经影像研究人员提供了更加强大、稳定的分析工具。这些改进不仅扩展了库的功能范围,也显著提升了用户体验和分析流程的可靠性,使复杂的神经影像分析变得更加高效和可重复。

登录后查看全文
热门项目推荐

项目优选

收起
openHiTLS-examplesopenHiTLS-examples
本仓将为广大高校开发者提供开源实践和创新开发平台,收集和展示openHiTLS示例代码及创新应用,欢迎大家投稿,让全世界看到您的精巧密码实现设计,也让更多人通过您的优秀成果,理解、喜爱上密码技术。
C
47
253
openHiTLSopenHiTLS
旨在打造算法先进、性能卓越、高效敏捷、安全可靠的密码套件,通过轻量级、可剪裁的软件技术架构满足各行业不同场景的多样化要求,让密码技术应用更简单,同时探索后量子等先进算法创新实践,构建密码前沿技术底座!
C
347
381
RuoYi-Vue3RuoYi-Vue3
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
871
516
ohos_react_nativeohos_react_native
React Native鸿蒙化仓库
C++
179
263
openGauss-serveropenGauss-server
openGauss kernel ~ openGauss is an open source relational database management system
C++
131
184
kernelkernel
deepin linux kernel
C
22
5
nop-entropynop-entropy
Nop Platform 2.0是基于可逆计算理论实现的采用面向语言编程范式的新一代低代码开发平台,包含基于全新原理从零开始研发的GraphQL引擎、ORM引擎、工作流引擎、报表引擎、规则引擎、批处理引引擎等完整设计。nop-entropy是它的后端部分,采用java语言实现,可选择集成Spring框架或者Quarkus框架。中小企业可以免费商用
Java
7
0
Cangjie-ExamplesCangjie-Examples
本仓将收集和展示高质量的仓颉示例代码,欢迎大家投稿,让全世界看到您的妙趣设计,也让更多人通过您的编码理解和喜爱仓颉语言。
Cangjie
335
1.09 K
harmony-utilsharmony-utils
harmony-utils 一款功能丰富且极易上手的HarmonyOS工具库,借助众多实用工具类,致力于助力开发者迅速构建鸿蒙应用。其封装的工具涵盖了APP、设备、屏幕、授权、通知、线程间通信、弹框、吐司、生物认证、用户首选项、拍照、相册、扫码、文件、日志,异常捕获、字符、字符串、数字、集合、日期、随机、base64、加密、解密、JSON等一系列的功能和操作,能够满足各种不同的开发需求。
ArkTS
31
0
CangjieCommunityCangjieCommunity
为仓颉编程语言开发者打造活跃、开放、高质量的社区环境
Markdown
1.08 K
0