Retro* 项目使用说明

1. 项目目录结构及介绍

Retro* 项目是一个用于学习逆向合成计划的机器学习项目。以下是项目的目录结构及其介绍：

• dataset/：存放项目所需的化学数据集文件夹。
• one_step_model/：包含预训练的一步模型。
• saved_models/：保存训练好的模型参数。
• retro_star/：项目的核心代码库，包括以下子目录和文件：
  • packages/：包含项目所需的子模块，例如 mlp_retrosyn 和 rdchiral。
  • example.py：一个示例 Python 脚本，展示了如何使用 Retro* 库。
  • retro_plan.py：执行逆向合成计划的脚本。
  • train.py：训练模型参数的脚本。
• environment.yml：用于创建 Conda 环境的配置文件。
• LICENSE：项目的 MIT 许可证文件。
• README.md：项目的说明文档。

2. 项目的启动文件介绍

项目的主要启动文件是 retro_plan.py。这个脚本负责根据输入的化学结构进行逆向合成计划的计算。以下是启动文件的简单介绍：

• retro_plan.py：此脚本可以用来进行逆向合成计划的计算。它接受命令行参数，例如 --use_value_fn 用于指定是否使用学习的价值函数。

示例命令行使用：

python retro_plan.py --use_value_fn

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件是 environment.yml，用于设置 Conda 环境，以确保项目依赖的正确安装。以下是配置文件的简单介绍：

• environment.yml：这个文件列出了项目运行所需的 Python 库及其版本，还包括了一些必要的非 Python 依赖。

配置文件示例内容：

name: retro_star_env
dependencies:
  - python=3.8
  - pip
  - pip:
    - -e .
    - -e retro_star/packages/mlp_retrosyn
    - -e retro_star/packages/rdchiral

使用以下命令创建 Conda 环境：

conda env create -f environment.yml

之后，激活环境：

conda activate retro_star_env

以上就是 Retro* 项目的使用说明，包括目录结构介绍、启动文件介绍和配置文件介绍。希望这些信息对您使用本项目有所帮助。