HE2RNA_code 项目启动与配置教程

1. 项目目录结构及介绍

HE2RNA_code 项目的目录结构如下：

HE2RNA_code/
├── data/               # 存储数据集文件
├── notebooks/          # Jupyter 笔记本文件，用于数据探索和模型训练
├── src/                # 源代码目录
│   ├── __init__.py     # 初始化文件
│   ├── data            # 数据处理相关代码
│   ├── features        # 特征工程相关代码
│   ├── models          # 模型构建和训练相关代码
│   └── utils           # 实用工具代码
├── tests/              # 测试代码目录
├── requirements.txt    # 项目依赖的Python库
├── setup.py            # 项目设置文件
└── README.md           # 项目说明文件

• data/：存储项目所需的数据集文件。
• notebooks/：包含项目相关的Jupyter笔记本，用于数据探索和模型训练。
• src/：源代码目录，包含项目的核心代码。
  • data：数据处理相关代码，如数据清洗、加载等。
  • features：特征工程相关代码，如特征提取、选择等。
  • models：模型构建和训练相关代码，包括不同模型的实现和训练过程。
  • utils：实用工具代码，如辅助函数、配置管理等。
• tests/：测试代码目录，用于确保代码质量。
• requirements.txt：列出项目依赖的Python库，以便于环境配置。
• setup.py：项目设置文件，用于定义项目的基本信息和依赖。
• README.md：项目说明文件，提供项目的概述和使用方法。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动主要是通过Jupyter笔记本进行。在 notebooks/ 目录下，你可以找到多个.ipynb文件，这些文件是交互式的Python脚本，可以在Jupyter环境中直接运行。

启动Jupyter笔记本的步骤如下：

1. 在项目根目录下打开终端。
2. 运行命令 jupyter notebook。
3. 在浏览器中打开出现的URL，通常是 http://localhost:8888/。
4. 在Jupyter界面中，导航到 notebooks/ 目录，选择相应的笔记本文件进行打开和运行。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置主要通过修改src/utils/config.py文件进行。该文件包含了项目运行所需的各种参数和配置信息，例如数据路径、模型参数、训练设置等。

以下是一个配置文件的示例：

# src/utils/config.py

# 数据路径配置
DATA_PATH = 'data/'

# 模型参数配置
MODEL_NAME = 'He2RnaModel'
LEARNING_RATE = 0.001
BATCH_SIZE = 32

# 训练设置配置
NUM_EPOCHS = 10
VALIDATION_SPLIT = 0.2

# 其他配置
# ...

在运行项目之前，确保修改config.py文件中的参数以适应你的具体需求和环境。