RDKit项目在GCC 15下的编译问题分析与解决方案

RDKit作为一个开源的化学信息学工具包，近期在GCC 15编译器环境下出现了编译失败的问题。本文将深入分析这一问题的技术背景、产生原因以及解决方案。

问题背景

在最新的GCC 15编译器中，默认的C语言标准从GNU17变更为GNU23。这一变更导致RDKit项目中的部分C代码无法通过编译，具体表现为在构建过程中出现了多个函数参数不匹配的错误。

技术分析

问题的核心出现在RDKit的聚类算法实现代码中（hc.c文件）。该文件使用了较为古老的K&R风格函数声明方式，这种声明方式在现代C语言标准中已经不再推荐使用。具体表现为：

1. 函数ioffset_被声明为无参数形式（extern integer ioffset_();）
2. 但在实际调用时却传入了3个参数
3. 函数定义处也没有正确声明参数列表

这种代码风格在早期的C语言中是允许的，但在现代C标准中，特别是GNU23标准下，编译器会严格执行函数声明与调用的一致性检查。

解决方案

经过验证，最合理的解决方案是在CMake构建系统中明确指定C语言标准版本。具体做法是在项目的CMakeLists.txt文件中添加以下配置：

set(CMAKE_C_STANDARD 99)
set(CMAKE_C_STANDARD_REQUIRED ON)

这一配置的作用是：

1. 明确要求使用C99标准进行编译
2. 确保编译器必须支持指定的标准版本
3. 避免了GCC 15默认GNU23标准带来的严格检查

技术建议

对于长期维护的项目，我们建议：

1. 逐步将遗留的K&R风格代码迁移到现代C标准
2. 在构建系统中明确指定语言标准版本
3. 定期在不同编译器版本下进行兼容性测试

这一问题的解决不仅保证了RDKit在最新编译器环境下的可用性，也为项目的长期维护奠定了更好的基础。