VoxelMorph 开源项目教程

1. 项目目录结构及介绍

VoxelMorph 的代码库组织如下：

.
├── scripts               # 包含示例脚本和训练脚本
│   ├── train.py          # 训练模型的主脚本
│   └── ...                # 其他相关脚本
├── voxelmorph            # 主体代码库，实现学习图像注册的核心算法
│   ├── models.py         # 模型定义
│   ├── losses.py         # 损失函数
│   ├── ...                # 更多相关模块
├── setups.py             # 配置文件加载器
├── examples              # 示例数据和结果
└── ...

这个结构中，scripts 文件夹包含了用于训练和实验的Python脚本，voxelmorph 是核心算法模块，而 setups.py 用于加载不同的配置设置。

2. 项目的启动文件介绍

主要的启动文件位于 scripts/train.py 中。此脚本可用于训练一个VoxelMorph模型。为了运行它，你需要提供训练参数，例如输入数据路径、预处理设置、模型架构等。你可以通过修改脚本内的参数或通过命令行选项传递这些值。

python scripts/train.py --data_path /path/to/data --config config.yml

这里 --config 参数用于指定配置文件的位置，该文件通常在 setups.py 中被解析和应用。

3. 项目的配置文件介绍

VoxelMorph 使用YAML格式的配置文件来定制训练过程的各个方面。配置文件包括但不限于以下部分：

model:
  name: voxel_morph    # 模型名称
  encoder_depth: 4     # 编码器层数
  decoder_depth: 4     # 解码器层数

data:
  train:
    path: /path/to/train/data # 训练数据集路径
    batch_size: 4           # 批次大小
    transform: True         # 是否启用数据增强
  val:
    path: /path/to/validation/data  # 验证数据集路径
    batch_size: 4

optimizer:
  name: Adam       # 优化器类型
  lr: 1e-4         # 学习率

training:
  epochs: 100      # 训练轮数
  save_freq: 10    # 每隔多少轮保存一次模型
  log_freq: 20     # 每隔多少步打印日志

配置文件允许你在不改变代码的情况下调整训练参数，如学习率、批次大小或模型架构。要使用自定义配置，只需将文件路径传递给 train.py 脚本。

请注意，由于未提供具体的配置文件样例，以上是一个概括性的配置模板。实际的配置可能包含更多细节，具体取决于项目的完整性和需求。请参阅项目仓库中的实际配置文件以获取更多信息。