t-SNE 开源项目使用教程

1. 项目的目录结构及介绍

tsne/
├── LICENSE
├── README.md
├── setup.py
├── tsne/
│   ├── __init__.py
│   ├── bh_sne.pyx
│   ├── tests/
│   │   ├── __init__.py
│   │   └── test_tsne.py
│   └── utils.py
└── examples/
    └── example.py

• LICENSE: 项目许可证文件。
• README.md: 项目说明文档。
• setup.py: 项目安装脚本。
• tsne/: 项目核心代码目录。
  • __init__.py: 模块初始化文件。
  • bh_sne.pyx: Barnes-Hut t-SNE 实现。
  • tests/: 测试代码目录。
    • __init__.py: 测试模块初始化文件。
    • test_tsne.py: t-SNE 测试代码。
  • utils.py: 工具函数文件。
• examples/: 示例代码目录。
  • example.py: 使用示例代码。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件是 examples/example.py。该文件提供了一个简单的示例，展示了如何使用 t-SNE 进行数据降维和可视化。

import numpy as np
from tsne import TSNE

# 生成示例数据
X = np.array([[0, 0, 0], [0, 1, 1], [1, 0, 1], [1, 1, 1]])

# 使用 t-SNE 进行降维
model = TSNE(n_components=2, random_state=0)
X_embedded = model.fit_transform(X)

print(X_embedded)

3. 项目的配置文件介绍

项目没有显式的配置文件，但可以通过修改 setup.py 文件来调整项目的安装配置。例如，可以修改依赖项或添加额外的安装选项。

from setuptools import setup, find_packages
from Cython.Build import cythonize

setup(
    name='tsne',
    version='0.1',
    packages=find_packages(),
    install_requires=[
        'numpy',
        'scipy',
    ],
    ext_modules=cythonize("tsne/bh_sne.pyx"),
)

通过修改 setup.py 文件，可以调整项目的依赖项、版本号等信息。