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tacoma 的项目扩展与二次开发

2025-05-27 13:19:42作者:贡沫苏Truman

项目的基础介绍

tacoma 是一个开源的 C++/Python 联合包,主要用于建模和分析无向、无权重的时态网络,特别关注于(但不仅限于)人脸对脸接触网络。该项目提供了快速的工具来分析时态接触网络,生成替代网络,并模拟吉尔皮斯(Gillespie)过程。

项目的核心功能

  • 连续时间的网络描述:支持在连续时间中描述网络,包含离散时间描述。
  • 原生网络格式:提供两种原生网络格式(tc.edge_lists 和 tc.edge_changes)。
  • 网络数据共享:使用简单的便携式文件格式 .taco 作为标准化的网络数据共享方式。
  • 生成替代网络:提供四种不同的模型来生成替代网络。
  • 模拟过程:支持在时态网络上模拟吉尔皮斯过程(例如,流行病传播)。
  • 可视化工具:提供多种交互式可视化网络的方式。
  • 网络操作和分析:简单的函数来操作和分析网络的统计和结构属性。

项目使用了哪些框架或库?

tacoma 项目主要使用了以下框架或库:

  • C++11:C++核心库,用于实现高效的算法。
  • pybind11:用于 C++ 和 Python 之间的绑定。
  • matplotlibnetworkxpython-louvain:这些是可选的库,如果需要使用绘图功能则需安装。

项目的代码目录及介绍

项目的代码目录结构大致如下:

tacoma/
|-- docs/             # 项目文档
|-- img/              # 项目图片
|-- jupyter_notebooks/ # Jupyter 笔记本示例
|-- logo/             # 项目标识
|-- sandbox/          # 沙盒目录,用于开发和测试
|-- tacoma/           # 核心代码目录
|   |-- __init__.py
|   `-- ...
|-- .gitattributes
|-- .gitignore
|-- LICENSE           # 许可文件
|-- MANIFEST.in
|-- Makefile
|-- README.md         # 项目说明文件
|-- setup.py          # Python 包设置文件

对项目进行扩展或者二次开发的方向

  1. 增加对有向和加权时态网络的支持:目前项目尚不支持有向和加权网络,这是一个潜在的扩展方向。
  2. 优化和增加算法:可以针对时态网络的特定问题,优化现有算法或增加新的算法。
  3. 改进可视化工具:根据用户需求,改进和增加网络的可视化工具和功能。
  4. 扩展模拟功能:除了流行病传播模拟,可以扩展其他类型的动态过程模拟。
  5. 增强文档和示例:完善项目的文档和示例,帮助新用户更快上手和使用项目。
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