icml18-jtnn 项目使用教程

1. 项目目录结构及介绍

icml18-jtnn/
├── bo/
│   ├── README.md
│   └── ...
├── data/
│   └── ...
├── fast_jtnn/
│   ├── README.md
│   └── ...
├── fast_molvae/
│   ├── README.md
│   └── ...
├── jtnn/
│   ├── README.md
│   └── ...
├── molopt/
│   ├── README.md
│   └── ...
├── molvae/
│   ├── README.md
│   └── ...
├── .gitignore
├── LICENSE
├── README.md
├── paradigm.png
└── requirements.txt

目录结构介绍

• bo/: 包含用于贝叶斯优化实验的脚本。请阅读 bo/README.md 获取详细信息。
• data/: 数据文件夹，包含项目所需的数据。
• fast_jtnn/: 包含模型实现的代码。
• fast_molvae/: 包含用于VAE训练的代码。请阅读 fast_molvae/README.md 获取详细信息。
• jtnn/: 包含模型公式的代码。
• molopt/: 包含用于联合训练VAE和属性预测器的脚本。请阅读 molopt/README.md 获取详细信息。
• molvae/: 包含仅用于训练VAE模型的脚本。请阅读 molvae/README.md 获取详细信息。
• .gitignore: Git忽略文件。
• LICENSE: 项目许可证文件。
• README.md: 项目主文档。
• paradigm.png: 项目图示文件。
• requirements.txt: 项目依赖文件。

2. 项目启动文件介绍

项目的启动文件主要集中在 fast_molvae/ 目录下。具体启动文件为 fast_molvae/train.py。该文件用于启动VAE模型的训练过程。

启动步骤

1. 进入 fast_molvae/ 目录：

   cd fast_molvae/
   

2. 运行训练脚本：

   python train.py
   

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件主要为 requirements.txt，该文件列出了项目运行所需的依赖包。

requirements.txt 内容

rdkit
numpy
torch

安装依赖

在项目根目录下运行以下命令安装依赖：

pip install -r requirements.txt

以上步骤完成后，您就可以顺利启动并运行 icml18-jtnn 项目。