scRNA-seq.datasets项目使用手册
2024-09-08 10:02:24作者:俞予舒Fleming
项目目录结构及介绍
scRNA-seq.datasets 是一个致力于提供公共单细胞RNA测序数据集访问的开源项目。该项目基于GitHub,其基本目录结构布局精简且易于导航,尽管具体的版本在我所参考的信息中未详尽展示,但我们可以推断出一般开源数据集项目可能拥有的结构:
- 根目录:
README.md: 项目简介,快速入门指南以及贡献者须知。LICENSE: 许可证文件,说明了如何合法地使用这些数据集。data/: 存放预处理后的数据集文件,通常以特定格式如.rds或原始文本格式存在。docs/: 文档部分,可能包括API文档、用户手册等。R/: 包含所有用于操作数据集的R函数源代码。inst/extdata/: 可能包含示例数据或外部数据文件,便于用户测试。man/: 自动生成的R包帮助文件。.gitignore: 指定不纳入版本控制的文件或目录。
项目的启动文件介绍
在R语言的开源项目中,启动过程往往不是通过单独的“启动文件”完成,而是通过加载R包来实现功能。对于scRNA-seq.datasets,主要的交互点可能是通过R会话调用该包提供的函数。例如,开始使用时,用户将通过R命令library(scRNAseq.datasets)来加载此包,随后可以通过surveyDatasets()来探索可用的数据集。
项目的配置文件介绍
这个特定的项目似乎没有强调传统的配置文件概念,比如.config文件或者YAML/JSON配置文件,因为配置主要是通过R函数参数来进行的。用户无需手动编辑配置文件来改变行为。然而,若要上传新的数据集或是有特定的个性化设置需求,可能会涉及到元数据的描述,这通常是通过在贡献过程中遵守项目的贡献指南(比如通过PR流程)来完成的,而非传统意义上的配置文件修改。
示例操作
虽然不涉及直接的配置文件操作,但是创建或更新数据集的过程可能需要遵循一定的步骤,比如修改Markdown文件来添加新数据集的描述,或是在提交更改时明确版本和名称信息。这一系列操作更多是通过GitHub的Pull Request (PR) 流程进行管理,而具体配置细节嵌入到PR描述或相关脚本中。
请注意,实际的目录结构和文件内容可能会依据项目的最新迭代有所变化。建议直接查看项目的GitHub页面获取最新、最准确的信息。
登录后查看全文
热门项目推荐
ERNIE-4.5-VL-28B-A3B-ThinkingERNIE-4.5-VL-28B-A3B-Thinking 是 ERNIE-4.5-VL-28B-A3B 架构的重大升级,通过中期大规模视觉-语言推理数据训练,显著提升了模型的表征能力和模态对齐,实现了多模态推理能力的突破性飞跃Python00
Kimi-K2-ThinkingKimi K2 Thinking 是最新、性能最强的开源思维模型。从 Kimi K2 开始,我们将其打造为能够逐步推理并动态调用工具的思维智能体。通过显著提升多步推理深度,并在 200–300 次连续调用中保持稳定的工具使用能力,它在 Humanity's Last Exam (HLE)、BrowseComp 等基准测试中树立了新的技术标杆。同时,K2 Thinking 是原生 INT4 量化模型,具备 256k 上下文窗口,实现了推理延迟和 GPU 内存占用的无损降低。Python00
MiniMax-M2MiniMax-M2是MiniMaxAI开源的高效MoE模型,2300亿总参数中仅激活100亿,却在编码和智能体任务上表现卓越。它支持多文件编辑、终端操作和复杂工具链调用Python00
HunyuanVideo-1.5HunyuanVideo-1.5作为一款轻量级视频生成模型,仅需83亿参数即可提供顶级画质,大幅降低使用门槛。该模型在消费级显卡上运行流畅,让每位开发者和创作者都能轻松使用。本代码库提供生成创意视频所需的实现方案与工具集。00
MiniCPM-V-4_5MiniCPM-V 4.5 是 MiniCPM-V 系列中最新且功能最强的模型。该模型基于 Qwen3-8B 和 SigLIP2-400M 构建,总参数量为 80 亿。与之前的 MiniCPM-V 和 MiniCPM-o 模型相比,它在性能上有显著提升,并引入了新的实用功能Python00
GOT-OCR-2.0-hf阶跃星辰StepFun推出的GOT-OCR-2.0-hf是一款强大的多语言OCR开源模型,支持从普通文档到复杂场景的文字识别。它能精准处理表格、图表、数学公式、几何图形甚至乐谱等特殊内容,输出结果可通过第三方工具渲染成多种格式。模型支持1024×1024高分辨率输入,具备多页批量处理、动态分块识别和交互式区域选择等创新功能,用户可通过坐标或颜色指定识别区域。基于Apache 2.0协议开源,提供Hugging Face演示和完整代码,适用于学术研究到工业应用的广泛场景,为OCR领域带来突破性解决方案。00
最新内容推荐
IEC61850建模工具及示例资源:智能电网自动化配置的完整指南 TextAnimator for Unity:打造专业级文字动画效果的终极解决方案 全球GEOJSON地理数据资源下载指南 - 高效获取地理空间数据的完整解决方案 全球36个生物多样性热点地区KML矢量图资源详解与应用指南 PANTONE潘通AI色板库:设计师必备的色彩管理利器 OMNeT++中文使用手册:网络仿真的终极指南与实用教程 深入解析Windows内核模式驱动管理器:系统驱动管理的终极利器 咖啡豆识别数据集:AI目标检测在咖啡质量控制中的革命性应用 LabVIEW串口通信开发全攻略:从入门到精通的完整解决方案 PhysioNet医学研究数据库:临床数据分析与生物信号处理的权威资源指南
项目优选
收起
deepin linux kernel
C
24
8
暂无简介
Dart
644
149
Ascend Extension for PyTorch
Python
203
219
本项目是CANN提供的数学类基础计算算子库,实现网络在NPU上加速计算。
C++
654
282
React Native鸿蒙化仓库
JavaScript
249
317
Nop Platform 2.0是基于可逆计算理论实现的采用面向语言编程范式的新一代低代码开发平台,包含基于全新原理从零开始研发的GraphQL引擎、ORM引擎、工作流引擎、报表引擎、规则引擎、批处理引引擎等完整设计。nop-entropy是它的后端部分,采用java语言实现,可选择集成Spring框架或者Quarkus框架。中小企业可以免费商用
Java
9
1
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
1.13 K
631
本项目是CANN提供的是一款高效、可靠的Transformer加速库,基于华为Ascend AI处理器,提供Transformer定制化场景的高性能融合算子。
C++
77
101
仓颉编译器源码及 cjdb 调试工具。
C++
130
861
仓颉编程语言运行时与标准库。
Cangjie
134
873