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【亲测免费】 Mordred:分子描述符计算器

2026-01-29 12:51:00作者:庞队千Virginia

Mordred 是一个用于计算分子描述符的开源项目,主要使用 Python 编程语言实现。该项目旨在为化学信息学领域提供一个高效、可靠的分子描述符计算工具。

1. 项目基础介绍和主要编程语言

Mordred 项目是基于 Python 语言的开源项目,它利用 RDKit 库来处理分子结构,并计算各种分子描述符。这些描述符在药物设计、分子建模和化学数据分析中具有重要应用价值。

2. 项目的核心功能

Mordred 的核心功能是计算分子的二维和三维描述符。它支持多种描述符类型,包括但不限于以下几种:

  • 拓扑描述符:如 Wiener 指数、Zagreb 指数等。
  • 几何描述符:如分子惯性矩、范德华体积等。
  • 电子描述符:如原子类型、键类型等。
  • 物理化学描述符:如疏水性、分子量、分子折射等。

用户可以通过命令行界面或 Python 库接口使用 Mordred,灵活地选择计算哪些描述符,以及输入输出的格式。

3. 项目最近更新的功能

根据最新的项目更新,Mordred 在以下方面进行了改进:

  • 性能优化:提升了分子描述符的计算速度,尤其是对于大型数据集的处理。
  • 功能扩展:增加了新的分子描述符,如信息含量、拓扑电荷等。
  • 错误修复:修复了一些在特定情况下可能出现的计算错误。
  • 文档完善:更新了项目文档,提供了更多使用示例和说明,帮助用户更好地理解和使用项目。

Mordred 的持续更新和发展为化学信息学领域的研究人员提供了一个强大的工具,有助于他们进行更深入的数据分析和模型构建。

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