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使用Reticulate创建Shiny应用:结合R与Python3的实战教程

2024-09-01 01:25:42作者:温艾琴Wonderful

本教程基于GitHub上的开源项目 shiny-reticulate-app,旨在引导您学习如何搭建一个同时利用R和Python3功能的Shiny应用程序。我们将深入探讨项目结构、关键文件及其用途。

1. 项目目录结构及介绍

此开源项目遵循典型的R Shiny应用结构,其主要组成部分如下:

shiny-reticulate-app/
├── Rprofile               # R环境配置文件,可能包括项目启动时执行的命令。
├── gitignore              # 忽略版本控制的文件列表。
├── LICENSE                # 许可证文件,表明项目遵守Apache-2.0协议。
├── README.md              # 主要的项目说明文件,介绍项目用途和快速入门指南。
├── python_functions.py    # 包含Python函数的脚本,用于在R中通过reticulate调用。
├── server.R               # Shiny应用的服务器逻辑部分,定义交互行为。
├── ui.R                   # Shiny应用的用户界面定义。
├── shiny-reticulate-app.Rproj  # R Studio项目文件,便于管理和打开项目。
  • Rprofile:在这个文件中,可以设置项目级的R选项或加载必要的库,对整个R会话进行预配置。

  • python_functions.py:存储Python代码,这些函数将被R通过reticulate包调用,实现与Python的交互。

  • server.R 和 ui.R:是Shiny应用的核心,分别负责应用的后端逻辑和服务前端展示。

  • shiny-reticulate-app.Rproj:RStudio项目文件,帮助管理和运行项目。

2. 项目的启动文件介绍

server.R

该文件包含了应用的逻辑处理部分,当应用运行时,它定义了数据处理流程、响应用户交互以及调用Python脚本等后台任务。通过reticulate,可以在其中轻松集成Python代码来执行特定的数据处理或分析任务。

ui.R

UI文件负责设计和布局Shiny应用的前端界面。用户所见的所有元素,如按钮、输入框、图表等,都是在这里定义的。它是用户与应用交互的门户,确保用户体验流畅。

3. 项目的配置文件介绍

Rprofile

虽然不严格被视为“配置文件”,但Rprofile在项目初始化时会被执行,用于自定义R会话的行为。在此文件中,可以通过reticulate相关命令预先设置Python环境,确保应用能够正确找到并使用所需的Python版本及虚拟环境,这在使用特定Python依赖时尤为重要。

此外,尽管没有直接列出像.Renviron这样的传统配置文件,对于管理环境变量(比如指定RETICULATE_PYTHON路径)来说,了解如何编辑或使用此类文件也是十分有用的,它们允许你在启动R会话时设置全局变量,间接影响到reticulate如何寻找Python解释器。

综上所述,此项目通过精心组织的结构和明确分工的文件,展示了如何结合R与Python的能力,为开发复合技术栈的数据科学应用提供了一个很好的示例框架。

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