DSI-Studio 使用教程

1. 项目介绍

DSI-Studio 是一款轻量级且用户友好的用于扩散MRI分析、纤维追踪和连接映射的软件。它允许研究人员和临床医生执行以下操作：

• 进行确定性纤维追踪和自动束映射
• 重建扩散模型
• 可视化和交互式编辑脑纤维
• 导出各种度量和输出

该软件支持Windows、macOS和Linux操作系统，无需安装或编译即可作为独立可执行文件分发。

2. 项目快速启动

以下是快速启动DSI-Studio的步骤：

# 安装与启动

## 下载
根据您的操作系统，从官方下载页面选择合适的二进制文件：
- Windows: dsi_studio_64.exe
- macOS: dsi_studio_mac.dmg
- Linux (Ubuntu): dsi_studio_ubuntu.zip

## 解压与运行
- Windows: 直接运行下载的 `dsi_studio_64.exe` 文件
- macOS: 打开 `dsi_studio_mac.dmg` 包并按照提示操作
- Linux: 解压 `dsi_studio_ubuntu.zip` 文件，然后运行 `dsi_studio` 可执行文件

# 示例数据测试

## 加载示例数据
- 启动DSI-Studio
- 在“纤维数据”选项卡下，找到 `.fz` 文件并点击“打开”按钮以启动追踪窗口

## 开始纤维追踪
- 点击“纤维追踪”按钮开始纤维追踪

## 结果可视化与导出
- 使用顶部菜单中的功能来可视化追踪结果和导出数据

3. 应用案例和最佳实践

应用案例

• 研究人员使用DSI-Studio进行扩散MRI数据分析，以研究大脑连接性和纤维束的形态。
• 临床医生利用该软件可视化患者的纤维束，以辅助诊断和治疗计划。

最佳实践

• 在进行纤维追踪之前，确保数据质量通过使用质量控制系统。
• 使用适当的扩散模型（如GQI或DTI）来重建数据。
• 为了提高追踪的准确性和可重复性，使用自定义或模板ROI进行追踪。

4. 典型生态项目

DSI-Studio作为扩散MRI分析的常用工具，与其他开源项目有良好的兼容性，以下是一些典型的生态项目：

• FSL (FMRIB Software Library): 用于脑成像数据分析的软件库。
• Connectome Viewer: 用于可视化脑连接组的工具。
• Brainstorm: 一个开源的脑电生理数据分析和可视化软件。

通过这些工具的协同使用，研究人员可以更全面地分析大脑结构和功能。