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BrainSpace 项目安装与使用教程

2024-09-27 08:19:07作者:贡沫苏Truman

1. 项目的目录结构及介绍

BrainSpace 项目的目录结构如下:

BrainSpace/
├── brainspace/
│   ├── __init__.py
│   ├── gradient.py
│   ├── null_models.py
│   └── ...
├── docs/
│   ├── conf.py
│   ├── index.rst
│   └── ...
├── matlab/
│   ├── BrainSpace.mltbx
│   ├── BrainSpace.prj
│   └── ...
├── .gitignore
├── CHANGELOG.txt
├── CITATION.cff
├── LICENSE
├── MANIFEST.in
├── README.rst
├── requirements.txt
├── setup.cfg
├── setup.py
└── ...

目录结构介绍

  • brainspace/: 包含 BrainSpace 的核心 Python 代码,如 gradient.pynull_models.py 等。
  • docs/: 包含项目的文档文件,如 conf.pyindex.rst 等。
  • matlab/: 包含 BrainSpace 的 MATLAB 版本相关文件,如 BrainSpace.mltbxBrainSpace.prj 等。
  • .gitignore: Git 忽略文件列表。
  • CHANGELOG.txt: 项目更新日志。
  • CITATION.cff: 项目引用信息。
  • LICENSE: 项目许可证文件。
  • MANIFEST.in: 打包清单文件。
  • README.rst: 项目介绍和使用说明。
  • requirements.txt: Python 依赖包列表。
  • setup.cfg: 项目配置文件。
  • setup.py: Python 项目安装脚本。

2. 项目的启动文件介绍

BrainSpace 项目的启动文件主要是 setup.pybrainspace/__init__.py

setup.py

setup.py 是 Python 项目的标准安装脚本,用于配置和安装项目。通过运行以下命令可以安装 BrainSpace:

python setup.py install

brainspace/__init__.py

__init__.py 文件是 Python 包的初始化文件,定义了包的初始化行为和导出的模块。用户可以通过以下方式导入 BrainSpace:

import brainspace

3. 项目的配置文件介绍

BrainSpace 项目的主要配置文件包括 setup.cfgrequirements.txt

setup.cfg

setup.cfg 是 Python 项目的配置文件,用于配置 setup.py 的行为。它包含了项目的元数据、依赖项、安装选项等信息。

requirements.txt

requirements.txt 文件列出了 BrainSpace 项目所需的 Python 依赖包及其版本。用户可以通过以下命令安装这些依赖:

pip install -r requirements.txt

通过以上步骤,您可以顺利安装和配置 BrainSpace 项目,并开始使用其功能进行神经影像和连接组数据的分析。

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