ChromosomeMappings项目使用教程
2025-04-17 19:46:51作者:晏闻田Solitary
1. 项目目录结构及介绍
ChromosomeMappings
项目包含以下目录和文件:
.gitignore
:指定Git应该忽略的文件和目录。BDGP6_UCSC2ensembl.txt
:果蝇基因组BDGP6版本中UCSC到Ensembl的染色体名称映射。BDGP6_ensembl2UCSC.txt
:果蝇基因组BDGP6版本中Ensembl到UCSC的染色体名称映射。- ...(类似文件,包含不同基因组版本的染色体名称映射)。
LICENSE
:项目使用的MIT许可证文件。README.md
:项目的说明文件。- ...(其他基因组版本的映射文件)。
每个.txt
文件都包含了两种基因组命名系统之间的染色体名称映射,格式为两列,第一列为来源系统的染色体名称,第二列为目标系统的染色体名称。
2. 项目的启动文件介绍
在ChromosomeMappings
项目中,并没有特定的启动文件。该项目主要是提供了一系列的染色体名称映射数据,供其他程序或脚本使用。用户可以根据需要,将这些映射数据集成到自己的生物信息学分析流程中。
3. 项目的配置文件介绍
本项目不包含特定的配置文件。映射文件本身即是数据文件,用户无需配置即可使用。如果用户需要将这些映射数据应用到自己的项目中,可能需要在脚本或程序中指定映射文件的路径。例如,如果使用UpdateContigNames
命令行工具来更新染色体名称,可能需要以下配置:
❯ cvbio UpdateContigNames \
-i input_file.gtf \
-o output_file.gtf \
-m path_to/GRCh38_ensembl2UCSC.txt \
--comment-chars '#' \
--columns 0 \
--skip-missing false
在上面的命令中,-m
参数后面的path_to/GRCh38_ensembl2UCSC.txt
是映射文件的路径,用户需要将其替换为映射文件的实际存储路径。其他参数用于指定输入文件、输出文件、注释字符、操作的列以及如何处理缺失的映射项。
登录后查看全文
热门项目推荐
cherry-studio
🍒 Cherry Studio 是一款支持多个 LLM 提供商的桌面客户端TypeScript037RuoYi-Vue3
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统Vue0406arkanalyzer
方舟分析器:面向ArkTS语言的静态程序分析框架TypeScript040GitCode百大开源项目
GitCode百大计划旨在表彰GitCode平台上积极推动项目社区化,拥有广泛影响力的G-Star项目,入选项目不仅代表了GitCode开源生态的蓬勃发展,也反映了当下开源行业的发展趋势。02CS-Books
🔥🔥超过1000本的计算机经典书籍、个人笔记资料以及本人在各平台发表文章中所涉及的资源等。书籍资源包括C/C++、Java、Python、Go语言、数据结构与算法、操作系统、后端架构、计算机系统知识、数据库、计算机网络、设计模式、前端、汇编以及校招社招各种面经~05openGauss-server
openGauss kernel ~ openGauss is an open source relational database management systemC++0145
热门内容推荐
最新内容推荐
Visual-RFT项目中模型路径差异的技术解析 Beyla项目中的HTTP2连接检测问题解析 Microcks在OpenShift上部署Keycloak PostgreSQL的权限问题解析 RaspberryMatic项目中HmIP-BWTH温控器假期模式设置问题分析 Lets-Plot 库中条形图标签在坐标轴反转时的定位问题解析 BedrockConnect项目版本兼容性问题解析与解决方案 LiquidJS 10.21.0版本新增数组过滤功能解析 Mink项目中Selenium驱动切换iframe的兼容性问题分析 Lichess移动端盲棋模式字符串优化解析 sbctl验证功能JSON输出问题解析
项目优选
收起

🔥LeetCode solutions in any programming language | 多种编程语言实现 LeetCode、《剑指 Offer(第 2 版)》、《程序员面试金典(第 6 版)》题解
Java
51
15

🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
535
406

openGauss kernel ~ openGauss is an open source relational database management system
C++
63
145

React Native鸿蒙化仓库
C++
120
207

🍒 Cherry Studio 是一款支持多个 LLM 提供商的桌面客户端
TypeScript
397
37

本仓将收集和展示高质量的仓颉示例代码,欢迎大家投稿,让全世界看到您的妙趣设计,也让更多人通过您的编码理解和喜爱仓颉语言。
Cangjie
297
1.03 K

旨在打造算法先进、性能卓越、高效敏捷、安全可靠的密码套件,通过轻量级、可剪裁的软件技术架构满足各行业不同场景的多样化要求,让密码技术应用更简单,同时探索后量子等先进算法创新实践,构建密码前沿技术底座!
C
98
251

本仓将收集和展示仓颉鸿蒙应用示例代码,欢迎大家投稿,在仓颉鸿蒙社区展现你的妙趣设计!
Cangjie
358
342

🔥🔥超过1000本的计算机经典书籍、个人笔记资料以及本人在各平台发表文章中所涉及的资源等。书籍资源包括C/C++、Java、Python、Go语言、数据结构与算法、操作系统、后端架构、计算机系统知识、数据库、计算机网络、设计模式、前端、汇编以及校招社招各种面经~
50
5

为非计算机科班出身 (例如财经类高校金融学院) 同学量身定制,新手友好,让学生以亲身实践开源开发的方式,学会使用计算机自动化自己的科研/创新工作。案例以量化投资为主线,涉及 Bash、Python、SQL、BI、AI 等全技术栈,培养面向未来的数智化人才 (如数据工程师、数据分析师、数据科学家、数据决策者、量化投资人)。
Jupyter Notebook
51
54