开源项目推荐:Chemistry Development Kit (CDK)
2026-01-29 11:47:54作者:宗隆裙
项目基础介绍和主要编程语言
Chemistry Development Kit (CDK) 是一个开源的 Java 库,专注于化学信息学和生物信息学领域。该项目由 CDK 开发团队维护,自 1997 年以来一直在不断发展。CDK 的主要编程语言是 Java,适用于需要处理化学分子和反应的开发者和研究人员。
项目核心功能
CDK 提供了丰富的功能,主要包括:
- 分子和反应的价键表示:支持分子和反应的结构表示,包括价键和电子分布。
- 文件格式读写:支持多种化学文件格式的读写,如 SMILES、SDF、InChI、Mol2 和 CML 等。
- 高效的分子处理算法:包括环查找、Kekulisation、芳香性检测、坐标生成和渲染等。
- 分子标识符:生成和处理分子和反应的唯一标识符,便于快速搜索和匹配。
- 子结构和 SMARTS 模式搜索:支持复杂的子结构搜索和 SMARTS 模式匹配。
- 指纹方法:提供多种指纹方法,如 ECFP、Daylight、MACCS 等,用于相似性搜索。
- QSAR 描述符计算:支持定量结构-活性关系(QSAR)描述符的计算,用于药物设计和化学分析。
项目最近更新的功能
CDK 项目最近更新的功能包括:
- 改进的分子渲染功能:增强了分子结构的渲染效果,提供更清晰的图像输出。
- 扩展的文件格式支持:新增了对更多化学文件格式的支持,如 XYZ 格式。
- 优化的高效算法:对现有的分子处理算法进行了优化,提升了处理速度和准确性。
- 增强的 API 文档:更新了 JavaDoc 文档,提供了更详细的 API 使用说明和示例代码。
- Bug 修复和稳定性提升:修复了多个已知的 Bug,提升了项目的整体稳定性和可靠性。
通过这些更新,CDK 项目在化学信息学和生物信息学领域的应用更加广泛和深入,为开发者提供了更强大的工具和资源。
登录后查看全文
热门项目推荐
相关项目推荐
Kimi-K2.5Kimi K2.5 是一款开源的原生多模态智能体模型,它在 Kimi-K2-Base 的基础上,通过对约 15 万亿混合视觉和文本 tokens 进行持续预训练构建而成。该模型将视觉与语言理解、高级智能体能力、即时模式与思考模式,以及对话式与智能体范式无缝融合。Python00- QQwen3-Coder-Next2026年2月4日,正式发布的Qwen3-Coder-Next,一款专为编码智能体和本地开发场景设计的开源语言模型。Python00
xw-cli实现国产算力大模型零门槛部署,一键跑通 Qwen、GLM-4.7、Minimax-2.1、DeepSeek-OCR 等模型Go06
PaddleOCR-VL-1.5PaddleOCR-VL-1.5 是 PaddleOCR-VL 的新一代进阶模型,在 OmniDocBench v1.5 上实现了 94.5% 的全新 state-of-the-art 准确率。 为了严格评估模型在真实物理畸变下的鲁棒性——包括扫描伪影、倾斜、扭曲、屏幕拍摄和光照变化——我们提出了 Real5-OmniDocBench 基准测试集。实验结果表明,该增强模型在新构建的基准测试集上达到了 SOTA 性能。此外,我们通过整合印章识别和文本检测识别(text spotting)任务扩展了模型的能力,同时保持 0.9B 的超紧凑 VLM 规模,具备高效率特性。Python00
KuiklyUI基于KMP技术的高性能、全平台开发框架,具备统一代码库、极致易用性和动态灵活性。 Provide a high-performance, full-platform development framework with unified codebase, ultimate ease of use, and dynamic flexibility. 注意:本仓库为Github仓库镜像,PR或Issue请移步至Github发起,感谢支持!Kotlin08
VLOOKVLOOK™ 是优雅好用的 Typora/Markdown 主题包和增强插件。 VLOOK™ is an elegant and practical THEME PACKAGE × ENHANCEMENT PLUGIN for Typora/Markdown.Less00
项目优选
收起
deepin linux kernel
C
27
11
OpenHarmony documentation | OpenHarmony开发者文档
Dockerfile
532
3.74 K
openEuler内核是openEuler操作系统的核心,既是系统性能与稳定性的基石,也是连接处理器、设备与服务的桥梁。
C
336
178
本项目是CANN提供的数学类基础计算算子库,实现网络在NPU上加速计算。
C++
886
596
Ascend Extension for PyTorch
Python
340
403
暂无简介
Dart
771
191
Nop Platform 2.0是基于可逆计算理论实现的采用面向语言编程范式的新一代低代码开发平台,包含基于全新原理从零开始研发的GraphQL引擎、ORM引擎、工作流引擎、报表引擎、规则引擎、批处理引引擎等完整设计。nop-entropy是它的后端部分,采用java语言实现,可选择集成Spring框架或者Quarkus框架。中小企业可以免费商用
Java
12
1
openJiuwen agent-studio提供零码、低码可视化开发和工作流编排,模型、知识库、插件等各资源管理能力
TSX
986
247
本仓将收集和展示高质量的仓颉示例代码,欢迎大家投稿,让全世界看到您的妙趣设计,也让更多人通过您的编码理解和喜爱仓颉语言。
Cangjie
416
4.21 K
React Native鸿蒙化仓库
JavaScript
303
355