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探索分子模拟新境界:LAMMPS初学者教程

2024-05-23 13:45:18作者:毕习沙Eudora

探索分子模拟新境界:LAMMPS初学者教程

项目介绍

LAMMPS Tutorials for Beginners 是一个专为希望学习和应用LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)的初学者设计的一系列交互式教程。这个开源项目由Matbinder贡献,并基于 Mississippi State University 中心的原始教程进行更新,现在你可以直接在浏览器中运行LAMMPS,无需复杂的本地配置。

项目技术分析

LAMMPS是一个强大的分子动力学模拟软件,广泛用于物理、化学、材料科学和生物系统的建模。这些教程通过Jupyter Notebook的形式呈现,让你能在轻松理解代码的同时,实时运行LAMMPS模拟。这得益于 Binder 服务,它允许你在云端无缝地运行和编辑教程中的每一个步骤。

项目及技术应用场景

  1. 基础操作:从计算晶体的最小能量结构开始,逐步教你如何使用LAMMPS。
  2. 输入与输出处理:学习如何通过命令行传递变量,并从日志文件中提取数据以进行MATLAB或Python绘图。
  3. 材料变形模拟:模拟材料在张力和压力下的形变,可视化结果。
  4. 复杂结构创建:创建并研究晶界,甚至观察其在应力下的断裂行为。
  5. 原子级指标计算:获取并分析每个原子的各种性能指标。
  6. 聚合物模拟:将100个单位原子的聚合物链引入LAMMPS模拟。

这些教程涵盖了从基础到进阶的多个领域,使你能对材料的微观行为有深入的理解,无论是学术研究还是工业应用都能受益。

项目特点

  1. 互动体验:所有教程都嵌入了可执行的Jupyter Notebook,提供即时反馈和动手实践的机会。
  2. 零门槛启动:无论你是否熟悉Python、Anaconda或Jupyter Notebook,这里都有简短的入门指南帮你快速上手。
  3. 持续更新:随着LAMMPS版本的更新,教程也将保持同步,确保你始终能学到最新的技术。
  4. 适应性广:适用于从学生到专业研究人员的各个层次,覆盖了多学科的应用场景。

立即点击此处开启你的LAMMPS之旅,探索分子世界的奥秘吧!

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