HiC_tools 开源项目使用教程

1. 项目的目录结构及介绍

HiC_tools 项目的目录结构如下：

HiC_tools/
├── README.md
├── data/
├── docs/
├── scripts/
└── tools/

• README.md: 项目的主介绍文件，包含项目的基本信息和使用说明。
• data/: 存放项目所需的数据文件。
• docs/: 存放项目的文档文件，包括详细的使用说明和教程。
• scripts/: 存放项目的脚本文件，用于数据处理和分析。
• tools/: 存放项目的核心工具文件，包括各种用于处理 Hi-C 数据的工具。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件主要位于 scripts/ 和 tools/ 目录中。以下是一些关键的启动文件：

• scripts/run_analysis.sh: 这是一个主要的启动脚本，用于运行整个数据分析流程。
• tools/hic_processing.py: 这是一个核心工具脚本，用于处理 Hi-C 数据。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件主要位于 data/ 目录中。以下是一些关键的配置文件：

• data/config.yaml: 这是一个主要的配置文件，包含项目运行所需的各种参数和路径设置。
• data/sample_data.txt: 这是一个示例数据文件，用于测试和演示项目的功能。

通过以上介绍，您可以更好地理解和使用 HiC_tools 开源项目。希望这份教程对您有所帮助！