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MetaWRAP 开源项目教程

2024-08-17 16:35:33作者:裴锟轩Denise

1. 项目的目录结构及介绍

MetaWRAP 是一个用于基因组解析的元基因组数据分析的灵活管道。项目的目录结构如下:

metaWRAP/
├── bin/
│   ├── config-metawrap
│   └── ...
├── databases/
│   └── ...
├── README.md
└── ...
  • bin/:包含可执行脚本和配置文件。
  • databases/:用于存储数据库文件。
  • README.md:项目介绍和使用说明。

2. 项目的启动文件介绍

MetaWRAP 的启动文件位于 bin/ 目录下,主要包括:

  • metawrap:主脚本,用于调用各个模块。

使用方法:

metawrap [module] --help

例如,运行组装模块:

metawrap assembly -h

3. 项目的配置文件介绍

MetaWRAP 的配置文件是 bin/config-metawrap,它包含了项目所需的数据库路径和其他配置选项。

配置文件示例:

# 数据库路径配置
DATABASE_PATH=/path/to/your/database

用户可以根据需要修改此文件,以指向正确的数据库位置。


以上是 MetaWRAP 开源项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这份文档能帮助你更好地理解和使用该项目。

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