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InteractiveComplexHeatmap 项目安装与使用指南

2025-04-22 05:10:23作者:范垣楠Rhoda

1. 项目目录结构及介绍

InteractiveComplexHeatmap 项目的目录结构如下所示:

InteractiveComplexHeatmap/
├── .gitignore
├── LICENSE
├── README.md
├── requirements.txt
├── setup.py
├── example_data/
│   ├── data1.csv
│   ├── data2.csv
│   └── ...
├── heatmap/
│   ├── __init__.py
│   ├── base.py
│   ├── layout.py
│   ├── plot.py
│   └── ...
└── tests/
    ├── __init__.py
    ├── test_base.py
    ├── test_layout.py
    └── ...
  • .gitignore:指定 Git 忽略的文件和目录。
  • LICENSE:项目的开源协议文件。
  • README.md:项目的说明文件,包含了项目的基本信息和如何使用。
  • requirements.txt:项目运行所需的第三方库列表。
  • setup.py:项目安装和部署的配置文件。
  • example_data/:示例数据目录,包含了用于测试和演示的数据文件。
  • heatmap/:项目的主要代码目录,包含了创建复杂热力图的类和函数。
  • tests/:单元测试目录,包含了用于验证代码功能的测试用例。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动通常是通过执行 setup.py 文件来安装项目依赖和包。在项目根目录下,运行以下命令:

python setup.py install

此命令会安装 requirements.txt 文件中列出的所有依赖项,并配置项目环境。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置主要通过 setup.py 文件进行。以下是一个基本的 setup.py 文件的内容介绍:

from setuptools import setup, find_packages

setup(
    name='InteractiveComplexHeatmap',
    version='0.1',
    packages=find_packages(),
    install_requires=[
        'matplotlib',
        'numpy',
        'pandas',
        # 其他依赖
    ],
    # 其他配置项
)

install_requires 部分列出了项目所需的第三方库,这些库在安装项目时会被自动安装。如果需要添加新的依赖,只需在此列表中添加相应的库名称和版本即可。

在开发过程中,可能还需要对 requirements.txt 文件进行编辑,以指定精确的依赖版本,确保环境的一致性。

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