SlicerDentalSegmentator 的安装和配置教程

项目基础介绍

SlicerDentalSegmentator 是一个开源项目，旨在为 dental CT 和 CBCT 图像提供全自动化的分割功能。该项目是基于 3D Slicer 扩展开发的，可以用于牙科影像处理。主要编程语言为 Python 和 CMake。

项目使用的关键技术和框架

该项目使用了 nnU-Net 框架，nnU-Net 是一个用于生物医学图像分割的深度学习框架，具有自我配置的特性。SlicerDentalSegmentator 通过该框架实现了高效准确的图像分割。

项目安装和配置的准备工作

在开始安装之前，请确保您的系统中已经安装了以下软件：

• Python（版本建议大于 3.6）
• 3D Slicer（版本 5.8.0 或更高）
• Git

安装所需的软件后，请按照以下步骤进行操作：

安装步骤

1. 克隆项目仓库

打开命令行工具，运行以下命令克隆项目：

git clone https://github.com/gaudot/SlicerDentalSegmentator.git

2. 安装依赖

进入项目目录，安装项目所需的 Python 依赖：

pip install -r requirements.txt

3. 准备 Slicer 插件

将克隆的项目文件夹中的 SlicerDentalSegmentator 文件夹复制到 3D Slicer 的扩展目录下。通常这个目录是：

C:/Program Files/Slicer/Slicer.app/Contents/Extensions-5.8/

如果您使用的是 Linux 或 macOS，路径可能有所不同。

4. 安装 Slicer 插件

启动 3D Slicer，在扩展管理器中刷新列表，您应该能够看到 "DentalSegmentator" 插件。点击安装。

5. 重启 Slicer

安装完成后，重启 3D Slicer。

6. 使用插件

在 3D Slicer 中加载 dental CT 或 CBCT 数据，然后在模块选择器中找到 "DentalSegmentator"，选择相应的数据集，点击 "Apply" 开始分割。

以上步骤即为 SlicerDentalSegmentator 的安装和配置过程，祝您使用愉快！