推荐使用:Conformer-Rotamer Ensemble Sampling Tool(CREST)
2024-06-03 22:50:53作者:毕习沙Eudora
项目介绍
CREST是Grimme团队在Bonn开发的基于xTB程序的扩展工具。它以IO为基础,作为一个并行计算调度器,用于创建和分析结构ensemble。这个项目的核心目标是为化学和材料科学领域提供高效、精确的分子构象和转矩分析。
项目技术分析
CREST巧妙地集成到了xtb程序中,通过Intel的ifort和icc编译器优化性能。它可以处理多核并行计算,并通过Meson或Cmake进行构建。此外,该项目还提供了预编译的二进制文件,以及conda环境下的安装选项,使得不同平台的用户都能轻松使用。
在算法层面,CREST利用了先进的量子化学方法,如半经验的Grimme's xTB方法,以快速且准确地评估分子构象的能量。这种方法对于大分子体系的构象搜索尤其有效,能够生成高覆盖率的结构ensemble。
项目及技术应用场景
CREST广泛应用于以下场景:
- 药物发现:预测小分子药物候选物的构象多样性,帮助理解与靶标蛋白的相互作用。
- 材料科学:研究聚合物和复合材料的构象变化,影响其物理和化学性质。
- 生物大分子模拟:探究蛋白质和核酸等复杂生物分子的构象空间,有助于结构生物学研究。
- 催化剂设计:探索反应中间体和过渡态的构象,提高催化效率的理解。
项目特点
- 兼容性强大:支持多种编译器和安装方式,包括Meson、Cmake、make以及conda环境。
- 并行计算优化:利用OpenMP实现多核并行计算,加快计算速度。
- 直观易用:提供详细的文档和应用示例,简化了用户的操作流程。
- 灵活性高:可与其他量子化学软件无缝对接,适用于各种计算需求。
- 科学研究贡献:相关研究已被多个知名学术期刊引用,证明其在理论化学领域的可靠性和影响力。
总的来说,无论您是从事化学研究、药物开发还是材料科学工作,CREST都是一个值得信赖的强大工具。立即加入,体验高效准确的分子结构分析吧!
登录后查看全文
热门项目推荐
相关项目推荐
PaddleOCR-VLPaddleOCR-VL 是一款顶尖且资源高效的文档解析专用模型。其核心组件为 PaddleOCR-VL-0.9B,这是一款精简却功能强大的视觉语言模型(VLM)。该模型融合了 NaViT 风格的动态分辨率视觉编码器与 ERNIE-4.5-0.3B 语言模型,可实现精准的元素识别。Python00- DDeepSeek-V3.2-ExpDeepSeek-V3.2-Exp是DeepSeek推出的实验性模型,基于V3.1-Terminus架构,创新引入DeepSeek Sparse Attention稀疏注意力机制,在保持模型输出质量的同时,大幅提升长文本场景下的训练与推理效率。该模型在MMLU-Pro、GPQA-Diamond等多领域公开基准测试中表现与V3.1-Terminus相当,支持HuggingFace、SGLang、vLLM等多种本地运行方式,开源内核设计便于研究,采用MIT许可证。【此简介由AI生成】Python00
openPangu-Ultra-MoE-718B-V1.1昇腾原生的开源盘古 Ultra-MoE-718B-V1.1 语言模型Python00
HunyuanWorld-Mirror混元3D世界重建模型,支持多模态先验注入和多任务统一输出Python00
AI内容魔方AI内容专区,汇集全球AI开源项目,集结模块、可组合的内容,致力于分享、交流。03
Spark-Scilit-X1-13BFLYTEK Spark Scilit-X1-13B is based on the latest generation of iFLYTEK Foundation Model, and has been trained on multiple core tasks derived from scientific literature. As a large language model tailored for academic research scenarios, it has shown excellent performance in Paper Assisted Reading, Academic Translation, English Polishing, and Review Generation, aiming to provide efficient and accurate intelligent assistance for researchers, faculty members, and students.Python00
GOT-OCR-2.0-hf阶跃星辰StepFun推出的GOT-OCR-2.0-hf是一款强大的多语言OCR开源模型,支持从普通文档到复杂场景的文字识别。它能精准处理表格、图表、数学公式、几何图形甚至乐谱等特殊内容,输出结果可通过第三方工具渲染成多种格式。模型支持1024×1024高分辨率输入,具备多页批量处理、动态分块识别和交互式区域选择等创新功能,用户可通过坐标或颜色指定识别区域。基于Apache 2.0协议开源,提供Hugging Face演示和完整代码,适用于学术研究到工业应用的广泛场景,为OCR领域带来突破性解决方案。00- HHowToCook程序员在家做饭方法指南。Programmer's guide about how to cook at home (Chinese only).Dockerfile013
- PpathwayPathway is an open framework for high-throughput and low-latency real-time data processing.Python00
热门内容推荐
1 freeCodeCamp全栈开发课程中React组件导出方式的衔接问题分析2 freeCodeCamp Cafe Menu项目中link元素的void特性解析3 freeCodeCamp全栈开发课程中React实验项目的分类修正4 freeCodeCamp博客页面工作坊中的断言方法优化建议5 freeCodeCamp论坛排行榜项目中的错误日志规范要求6 freeCodeCamp JavaScript高阶函数中的对象引用陷阱解析7 freeCodeCamp音乐播放器项目中的函数调用问题解析8 freeCodeCamp课程页面空白问题的技术分析与解决方案9 freeCodeCamp课程视频测验中的Tab键导航问题解析10 freeCodeCamp课程中屏幕放大器知识点优化分析
最新内容推荐
JavaWeb企业门户网站源码 - 企业级门户系统开发指南 中兴e读zedx.zed文档阅读器V4.11轻量版:专业通信设备文档阅读解决方案 TextAnimator for Unity:打造专业级文字动画效果的终极解决方案 CS1237半桥称重解决方案:高精度24位ADC称重模块完全指南 CrystalIndex资源文件管理系统:高效索引与文件管理的最佳实践指南 瀚高迁移工具migration-4.1.4:企业级数据库迁移的智能解决方案 WebVideoDownloader:高效网页视频抓取工具全面使用指南 IK分词器elasticsearch-analysis-ik-7.17.16:中文文本分析的最佳解决方案 Photoshop作业资源文件下载指南:全面提升设计学习效率的必备素材库 电脑PC网易云音乐免安装皮肤插件使用指南:个性化音乐播放体验
项目优选
收起
deepin linux kernel
C
23
6
OpenHarmony documentation | OpenHarmony开发者文档
Dockerfile
238
2.36 K
仓颉编程语言运行时与标准库。
Cangjie
122
95
暂无简介
Dart
539
117
仓颉编译器源码及 cjdb 调试工具。
C++
114
83
React Native鸿蒙化仓库
JavaScript
216
291
Ascend Extension for PyTorch
Python
77
109
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
995
588
本项目是CANN提供的数学类基础计算算子库,实现网络在NPU上加速计算。
C++
568
113
LLVM 项目是一个模块化、可复用的编译器及工具链技术的集合。此fork用于添加仓颉编译器的功能,并支持仓颉编译器项目。
C++
32
25