首页
/ 推荐使用:Conformer-Rotamer Ensemble Sampling Tool(CREST)

推荐使用:Conformer-Rotamer Ensemble Sampling Tool(CREST)

2024-06-03 22:50:53作者:毕习沙Eudora
crest
Conformer-Rotamer Ensemble Sampling Tool based on the xtb Semiempirical Extended Tight-Binding Program Package

项目介绍

CREST是Grimme团队在Bonn开发的基于xTB程序的扩展工具。它以IO为基础,作为一个并行计算调度器,用于创建和分析结构ensemble。这个项目的核心目标是为化学和材料科学领域提供高效、精确的分子构象和转矩分析。

CREST

项目技术分析

CREST巧妙地集成到了xtb程序中,通过Intel的iforticc编译器优化性能。它可以处理多核并行计算,并通过Meson或Cmake进行构建。此外,该项目还提供了预编译的二进制文件,以及conda环境下的安装选项,使得不同平台的用户都能轻松使用。

在算法层面,CREST利用了先进的量子化学方法,如半经验的Grimme's xTB方法,以快速且准确地评估分子构象的能量。这种方法对于大分子体系的构象搜索尤其有效,能够生成高覆盖率的结构ensemble。

项目及技术应用场景

CREST广泛应用于以下场景:

  1. 药物发现:预测小分子药物候选物的构象多样性,帮助理解与靶标蛋白的相互作用。
  2. 材料科学:研究聚合物和复合材料的构象变化,影响其物理和化学性质。
  3. 生物大分子模拟:探究蛋白质和核酸等复杂生物分子的构象空间,有助于结构生物学研究。
  4. 催化剂设计:探索反应中间体和过渡态的构象,提高催化效率的理解。

项目特点

  1. 兼容性强大:支持多种编译器和安装方式,包括Meson、Cmake、make以及conda环境。
  2. 并行计算优化:利用OpenMP实现多核并行计算,加快计算速度。
  3. 直观易用:提供详细的文档和应用示例,简化了用户的操作流程。
  4. 灵活性高:可与其他量子化学软件无缝对接,适用于各种计算需求。
  5. 科学研究贡献:相关研究已被多个知名学术期刊引用,证明其在理论化学领域的可靠性和影响力。

总的来说,无论您是从事化学研究、药物开发还是材料科学工作,CREST都是一个值得信赖的强大工具。立即加入,体验高效准确的分子结构分析吧!

查看详细文档
获取最新版本

crest
Conformer-Rotamer Ensemble Sampling Tool based on the xtb Semiempirical Extended Tight-Binding Program Package
热门项目推荐
相关项目推荐

项目优选

收起
CangjieCommunity
为仓颉编程语言开发者打造活跃、开放、高质量的社区环境
Markdown
669
0
RuoYi-Vue
🎉 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue & Element 的前后端分离权限管理系统,同时提供了 Vue3 的版本
Java
136
18
openHiTLS
旨在打造算法先进、性能卓越、高效敏捷、安全可靠的密码套件,通过轻量级、可剪裁的软件技术架构满足各行业不同场景的多样化要求,让密码技术应用更简单,同时探索后量子等先进算法创新实践,构建密码前沿技术底座!
C
10
4
redis-sdk
仓颉语言实现的Redis客户端SDK。已适配仓颉0.53.4 Beta版本。接口设计兼容jedis接口语义,支持RESP2和RESP3协议,支持发布订阅模式,支持哨兵模式和集群模式。
Cangjie
322
26
advanced-java
Advanced-Java是一个Java进阶教程,适合用于学习Java高级特性和编程技巧。特点:内容深入、实例丰富、适合进阶学习。
JavaScript
75.83 K
19.04 K
qwerty-learner
为键盘工作者设计的单词记忆与英语肌肉记忆锻炼软件 / Words learning and English muscle memory training software designed for keyboard workers
TSX
15.56 K
1.44 K
Jpom
🚀简而轻的低侵入式在线构建、自动部署、日常运维、项目监控软件
Java
1.41 K
292
Yi-Coder
Yi Coder 编程模型,小而强大的编程助手
HTML
30
5
easy-es
Elasticsearch 国内Top1 elasticsearch搜索引擎框架es ORM框架,索引全自动智能托管,如丝般顺滑,与Mybatis-plus一致的API,屏蔽语言差异,开发者只需要会MySQL语法即可完成对Es的相关操作,零额外学习成本.底层采用RestHighLevelClient,兼具低码,易用,易拓展等特性,支持es独有的高亮,权重,分词,Geo,嵌套,父子类型等功能...
Java
1.42 K
231
taro
开放式跨端跨框架解决方案,支持使用 React/Vue/Nerv 等框架来开发微信/京东/百度/支付宝/字节跳动/ QQ 小程序/H5/React Native 等应用。 https://taro.zone/
TypeScript
35.34 K
4.77 K