使用fusen项目维护R包的最佳实践

前言

在R语言生态系统中，包开发一直是一个需要遵循特定结构和规范的过程。传统的开发方式需要使用多个文件和工具，对于新手开发者来说学习曲线较为陡峭。fusen项目提供了一种创新的解决方案，通过扁平化的开发流程简化了R包的创建和维护工作。

fusen项目简介

fusen是一个旨在简化R包开发流程的工具集，它通过将函数代码、文档、测试和示例整合到单个R Markdown文件中，实现了"一站式"开发体验。这种方法特别适合快速原型开发和小型项目，同时也为传统R包开发提供了平滑过渡的可能性。

日常开发实践

添加新功能集

使用fusen的"Add {fusen} chunks"插件可以快速添加新的功能模块：

1. 使用计划创建的函数名命名代码块
2. 决定该函数是否需要导出给最终用户

创建新模板

当需要添加一组相关功能时，可以创建新的扁平化Rmd模板：

add_flat_template(template = "add")
# 或直接使用
add_additional()

维护策略选择

fusen提供了两种维护策略，开发者可根据项目阶段选择最适合的方式。

选项1：继续使用扁平模板

优点：

• 鼓励先文档后编码的开发模式
• 无需深入理解完整包结构
• 所有开发集中在单一文件中

缺点：

• 调试工具可能直接指向生成的R文件
• 可能让习惯传统开发的协作者困惑

适用场景：项目初期、快速原型开发阶段

选项2：传统维护方式

优点：

• 完全兼容RStudio的调试工具
• 便于与经验丰富的开发者协作
• 遵循标准包开发流程

缺点：

• 需要维护文档和测试的同步更新
• 需要熟悉完整的包结构

过渡方法：使用deprecate_flat_file()将扁平模板标记为弃用，直接修改生成的包文件。

传统R包的fusen整合

fusen可以与现有传统开发的R包无缝集成：

1. 不会修改或删除现有功能、测试和文档
2. 仅影响模板中包含的新功能相关文件
3. 支持渐进式迁移策略

实践案例演示

以下是在现有包中添加新功能的完整流程：

1. 添加新模板

fusen::add_flat_template("add")

2. 在模板中编写函数、示例和测试

#' My median
#' @param x Numeric vector
#' @inheritParams stats::median
#' @return Median value
#' @export
#' @examples
my_median <- function(x, na.rm = TRUE) {
  if (!is.numeric(x)) {
    stop("x should be numeric")
  }
  stats::median(x, na.rm = na.rm)
}

3. 添加测试用例

test_that("my_median works", {
  expect_equal(my_median(1:12), 6.5)
  expect_error(my_median("text"))
})

4. 膨胀模板生成完整包结构

fusen::inflate(flat_file = "dev/flat_additional.Rmd")

开发方式对比

传统开发方式	fusen开发方式
需要创建多个文件(R/, tests/, vignettes/)	单一文件包含所有内容
需要手动同步文档和测试	文档、测试与代码同处一处
频繁切换不同文件	专注单一开发环境
需要了解完整包结构	简化开发流程

最佳实践建议

1. 初期开发：优先使用选项1，保持简单工作流
2. 项目成熟：适时切换到选项2，便于长期维护
3. 版本控制：尽早使用Git管理变更
4. 文档可视化：使用fusen::draw_package_structure()生成包结构图
5. 渐进迁移：新功能使用fusen，旧功能保持原样

结语

fusen为R包开发带来了全新的思路，特别适合快速迭代和中小型项目。它既保留了传统开发的严谨性，又大幅降低了入门门槛。无论是全新项目还是现有包的扩展开发，fusen都能提供高效、一致的开发体验。开发者可以根据项目阶段和个人偏好，灵活选择最适合的工作流程。