【亲测免费】 开源项目安装与配置指南：Kilosort

1. 项目基础介绍

Kilosort 是一个用于神经科学研究的开源项目，专注于快速尖峰排序和漂移校正。该项目的主要目的是对神经信号进行高效的处理和分析。Kilosort 使用 Python 编程语言开发，并且依赖于多个科学计算库。

2. 项目使用的关键技术和框架

• Python：项目的主要编程语言。
• PyTorch：用于神经网络计算和GPU加速的库。
• NumPy：用于高性能数值计算的库。
• Matplotlib：用于生成图表和可视化数据。
• Qt：用于创建图形用户界面。

3. 项目安装和配置的准备工作

在开始安装前，请确保您的计算机满足以下要求：

• 操作系统：支持 Linux 和 Windows 64 位版本。
• GPU：至少8GB的GPU RAM。
• Python：安装 Anaconda 分发版本，推荐使用 Python 3.9 或 3.10。

安装步骤

1. 卸载旧版本（如有必要）

   如果您之前安装过 kilosort 环境，请先移除它：

   conda env remove -n kilosort
   

2. 创建新的 Anaconda 环境

   打开 Anaconda 提示符或命令提示符，创建一个名为 kilosort 的新环境：

   conda create --name kilosort python=3.9
   

   如果需要，也可以使用 Python 3.10。

3. 激活环境

   创建环境后，激活它：

   conda activate kilosort
   

4. 安装 kilosort

   安装带有GUI的完整版本：

   python -m pip install kilosort[gui]
   

   如果只需要最小版本，可以省略 [gui]。

5. 安装 GPU 版本的 PyTorch

   如果在安装过程中使用了 CPU 版本的 PyTorch，请先卸载它：

   pip uninstall torch
   

   然后安装 GPU 版本的 PyTorch：

   conda install pytorch pytorch-cuda=11.8 -c pytorch -c nvidia
   

   根据您的 GPU 驱动和 CUDA 版本，可能需要调整命令中的 CUDA 版本。

6. 安装其他依赖（可选）

   如果您希望在 Jupyter 笔记本中使用该环境，还需要安装 Jupyter 和 Matplotlib：

   conda install jupyter
   pip install notebook matplotlib
   

7. 运行 GUI

   使用以下命令启动 kilosort 的图形用户界面：

   python -m kilosort
   

完成以上步骤后，您应该已经成功安装并配置了 Kilosort 项目，可以开始使用了。如果在安装过程中遇到问题，请查看项目文档或相关社区讨论以获得帮助。