Polars项目中Python GIL导致的S3 CSV扫描死锁问题分析
2025-05-04 00:17:08作者:宣聪麟
问题背景
在Polars数据处理框架的最新版本中,当用户尝试使用scan_csv函数从S3存储桶读取CSV文件并调用explain()方法时,会出现线程死锁的情况。这个问题特别发生在Python环境下,与全局解释器锁(GIL)的管理机制有关。
问题现象
当执行以下典型代码时:
import polars as pl
_ = (pl.scan_csv("s3://any_bucket_doesnt_have_to_exist/file.csv")
.select(pl.len())
.explain())
程序会陷入无限等待状态,无法输出预期的执行计划解释。通过线程调用栈分析发现,主线程在等待CSV文件信息的同时,另一个线程在等待获取GIL,形成了典型的死锁场景。
技术分析
死锁形成机制
-
主线程行为:
- 持有GIL执行
explain()方法 - 进入Polars优化器逻辑
- 尝试获取CSV文件元数据信息
- 将元数据获取任务提交到线程池
- 在等待任务完成时仍持有GIL
- 持有GIL执行
-
工作线程行为:
- 从线程池获取元数据获取任务
- 需要调用Python代码进行AWS凭证初始化
- 尝试获取GIL但被主线程持有
- 陷入等待状态
根本原因
问题的核心在于Polars的优化器在执行计划解释时,会尝试获取数据源的元信息。对于S3上的CSV文件,这涉及到网络请求和AWS凭证处理。在Python环境下,凭证处理需要调用回Python代码,此时需要获取GIL。
而主线程在提交任务到线程池后,没有释放GIL就进入等待状态,导致工作线程无法获取GIL来完成需要Python交互的任务,形成了典型的"死锁四必要条件":
- 互斥条件:GIL一次只能被一个线程持有
- 请求与保持:主线程持有GIL并等待工作线程完成
- 不剥夺条件:Python不会强制剥夺线程的GIL
- 循环等待:主线程等待工作线程,工作线程等待主线程释放GIL
解决方案建议
短期修复方案
-
GIL释放策略:
- 在提交需要Python回调的任务到线程池前,主线程应主动释放GIL
- 使用PyO3的
Python::allow_threads机制临时释放GIL
-
执行计划优化:
- 对于
explain()操作,可以考虑不实际获取远程文件元数据 - 使用占位符或缓存信息代替实时网络请求
- 对于
长期架构改进
-
异步I/O整合:
- 采用完全异步的I/O模型处理远程文件访问
- 与Python的asyncio生态更好集成
-
凭证处理解耦:
- 将AWS凭证获取逻辑移出关键路径
- 实现预获取或缓存机制
-
执行计划分析优化:
- 区分需要元数据和不需要元数据的解释模式
- 提供"轻量级"解释选项
影响范围评估
该问题主要影响以下场景:
- 使用Python接口的Polars用户
- 从S3等云存储读取CSV文件
- 尝试在执行前分析查询计划
对于直接执行查询(collect())的情况,由于执行流程不同,不会触发此死锁条件。
开发者建议
对于遇到此问题的开发者,可以采取以下临时解决方案:
- 先执行
collect()再分析计划 - 本地缓存文件后再进行分析
- 使用较新版本的Polars(如果该问题已被修复)
对于Polars维护者,建议在以下关键点进行代码审查和修改:
polars-plan/src/plans/conversion/scans.rs中的元数据获取逻辑- 线程池任务提交时的GIL管理策略
- Python回调与Rust线程的交互边界
这个问题很好地展示了在混合Python/Rust环境中处理并发任务时的典型挑战,特别是当涉及GIL和外部系统交互时。通过合理设计线程交互和资源管理策略,可以有效避免此类问题。
登录后查看全文
热门项目推荐
相关项目推荐
kernelopenEuler内核是openEuler操作系统的核心,既是系统性能与稳定性的基石,也是连接处理器、设备与服务的桥梁。C051
MiniMax-M2.1从多语言软件开发自动化到复杂多步骤办公流程执行,MiniMax-M2.1 助力开发者构建下一代自主应用——全程保持完全透明、可控且易于获取。Python00
kylin-wayland-compositorkylin-wayland-compositor或kylin-wlcom(以下简称kywc)是一个基于wlroots编写的wayland合成器。 目前积极开发中,并作为默认显示服务器随openKylin系统发布。 该项目使用开源协议GPL-1.0-or-later,项目中来源于其他开源项目的文件或代码片段遵守原开源协议要求。C01
PaddleOCR-VLPaddleOCR-VL 是一款顶尖且资源高效的文档解析专用模型。其核心组件为 PaddleOCR-VL-0.9B,这是一款精简却功能强大的视觉语言模型(VLM)。该模型融合了 NaViT 风格的动态分辨率视觉编码器与 ERNIE-4.5-0.3B 语言模型,可实现精准的元素识别。Python00
GLM-4.7GLM-4.7上线并开源。新版本面向Coding场景强化了编码能力、长程任务规划与工具协同,并在多项主流公开基准测试中取得开源模型中的领先表现。 目前,GLM-4.7已通过BigModel.cn提供API,并在z.ai全栈开发模式中上线Skills模块,支持多模态任务的统一规划与协作。Jinja00
agent-studioopenJiuwen agent-studio提供零码、低码可视化开发和工作流编排,模型、知识库、插件等各资源管理能力TSX0126
Spark-Formalizer-X1-7BSpark-Formalizer 是由科大讯飞团队开发的专用大型语言模型,专注于数学自动形式化任务。该模型擅长将自然语言数学问题转化为精确的 Lean4 形式化语句,在形式化语句生成方面达到了业界领先水平。Python00
最新内容推荐
VSdebugChkMatch.exe:专业PDB签名匹配工具全面解析与使用指南 Solidcam后处理文件下载与使用完全指南:提升CNC编程效率的必备资源 中兴e读zedx.zed文档阅读器V4.11轻量版:专业通信设备文档阅读解决方案 深入解析Windows内核模式驱动管理器:系统驱动管理的终极利器 PhysioNet医学研究数据库:临床数据分析与生物信号处理的权威资源指南 STM32到GD32项目移植完全指南:从兼容性到实战技巧 Python开发者的macOS终极指南:VSCode安装配置全攻略 PCDViewer-4.9.0-Ubuntu20.04:专业点云可视化与编辑工具全面解析 基恩士LJ-X8000A开发版SDK样本程序全面指南 - 工业激光轮廓仪开发利器 昆仑通态MCGS与台达VFD-M变频器通讯程序详解:工业自动化控制完美解决方案
项目优选
收起
deepin linux kernel
C
26
10
OpenHarmony documentation | OpenHarmony开发者文档
Dockerfile
445
3.35 K
本项目是CANN提供的数学类基础计算算子库,实现网络在NPU上加速计算。
C++
823
398
Ascend Extension for PyTorch
Python
251
285
React Native鸿蒙化仓库
JavaScript
278
329
暂无简介
Dart
702
166
Nop Platform 2.0是基于可逆计算理论实现的采用面向语言编程范式的新一代低代码开发平台,包含基于全新原理从零开始研发的GraphQL引擎、ORM引擎、工作流引擎、报表引擎、规则引擎、批处理引引擎等完整设计。nop-entropy是它的后端部分,采用java语言实现,可选择集成Spring框架或者Quarkus框架。中小企业可以免费商用
Java
10
1
openEuler内核是openEuler操作系统的核心,既是系统性能与稳定性的基石,也是连接处理器、设备与服务的桥梁。
C
142
51
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
1.24 K
679
本项目是CANN开源社区的核心管理仓库,包含社区的治理章程、治理组织、通用操作指引及流程规范等基础信息
557
111