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QSARtuna 开源项目安装与使用教程

2025-04-22 00:39:46作者:史锋燃Gardner

1. 项目目录结构及介绍

QSARtuna 是一个用于QSAR(定量结构-活性关系)模型开发的Python库。项目的目录结构如下所示:

QSARtuna/
├── examples/             # 示例代码和测试数据
├── qsartuna/             # 包含QSARtuna库的主要代码
│   ├── __init__.py
│   ├── base/             # 基础类和函数
│   ├── datasets/         # 数据集处理相关模块
│   ├── feature_extractors/ # 特征提取器模块
│   ├── models/           # 模型算法模块
│   ├── utils/            # 工具模块
│   └── visualizations/   # 可视化模块
├── tests/                # 测试代码
├── documentation/        # 文档资料
├── requirements.txt      # 项目依赖
├── setup.py              # 项目设置文件
└── README.md             # 项目说明文件
  • examples/: 包含了使用QSARtuna的示例代码和一些测试数据,方便用户学习和测试。
  • qsartuna/: 这是QSARtuna库的核心目录,包含了所有的库代码。
  • tests/: 包含了项目的单元测试代码,用于确保代码质量。
  • documentation/: 包含了项目的文档资料,帮助用户更好地理解和使用项目。
  • requirements.txt: 列出了项目所依赖的Python库,用于安装依赖。
  • setup.py: 包含了项目的配置信息,用于安装和分发项目。
  • README.md: 项目说明文件,通常包含了项目的基本信息、安装指南和使用示例。

2. 项目的启动文件介绍

在QSARtuna项目中,并没有特定的启动文件。用户可以直接在Python环境中导入qsartuna模块,并使用其中的类和函数来构建QSAR模型。

例如,您可以在Python交互式环境或脚本中执行以下代码来导入QSARtuna:

import qsartuna as qs

之后,您可以使用qs来访问QSARtuna提供的各种功能和模型。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置主要通过setup.py文件进行。这个文件包含了项目的元数据和安装脚本,例如项目的名称、版本、描述、依赖关系等。

以下是一个简化的setup.py文件示例:

from setuptools import setup, find_packages

setup(
    name='QSARtuna',
    version='0.1.0',
    packages=find_packages(),
    install_requires=[
        'numpy',
        'scikit-learn',
        'rdkit',
        # 其他依赖
    ],
    # 其他配置信息...
)

在这个文件中,install_requires列表指定了项目的依赖,这些依赖会在安装项目时自动安装。用户可以通过以下命令安装QSARtuna:

pip install .

确保在执行此命令前,您已经在环境中安装了setuptools和wheel包。

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