DeepMD-kit训练偶极矩模型时出现NAN问题的分析与解决
2025-07-10 13:13:25作者:龚格成
问题描述
在使用DeepMD-kit v3.0.0的TensorFlow后端训练偶极矩(dipole)模型时,发现即使提供了参考数据,训练过程中输出的损失值仍然显示为NAN。相比之下,PyTorch后端在相同配置下能够正常输出训练损失值。
现象对比
TensorFlow后端输出的lcurve.out文件中,rmse_lc_val和rmse_lc_trn列始终显示为NAN,并伴随注释"# If there is no available reference data, rmse_*_{val,trn} will print nan"。
而PyTorch后端在相同配置下,能够正常输出局部偶极矩的训练和验证误差值,仅全局偶极矩部分显示为NAN。
问题根源分析
经过深入分析,发现问题源于数据文件命名规范的差异:
- DeepMD-kit v2.x版本使用"atomic_*.npy"作为原子偶极矩数据的文件名格式
- 在v3.0.0版本中,相关代码被修改为使用"atom_*.npy"格式
- TensorFlow后端的数据处理模块没有完全兼容这两种命名格式
- PyTorch后端的数据处理模块已经实现了对两种命名格式的兼容性支持
解决方案
为解决此问题,需要对TensorFlow后端的数据处理模块进行修改,使其能够同时识别"atom_.npy"和"atomic_.npy"两种文件命名格式。具体实现方式可参考PyTorch后端的兼容性处理逻辑。
修改后的代码应包含对两种文件名的检查机制,确保无论用户使用哪种命名约定,都能正确加载原子偶极矩数据。
技术背景
DeepMD-kit中的偶极矩模型训练需要两种类型的数据:
- 全局偶极矩数据(通常为system级别)
- 局部/原子偶极矩数据(atomic级别)
在模型训练过程中,系统会根据损失函数配置自动识别和使用相应类型的数据。当数据文件命名不规范或无法找到时,会导致训练过程中无法正确计算损失值,从而出现NAN。
最佳实践建议
为避免类似问题,建议用户:
- 统一使用"atomic_*.npy"作为原子偶极矩数据的文件名格式
- 在升级DeepMD-kit版本时,注意检查数据文件命名规范的变更
- 训练前验证数据是否被正确加载
- 关注训练日志中的警告信息,及时发现数据加载问题
总结
此问题凸显了深度学习框架中数据接口兼容性的重要性。通过标准化数据命名规范和完善兼容性处理,可以显著提升用户体验和框架的鲁棒性。DeepMD-kit团队将持续优化各后端的一致性,确保用户在不同后端上获得相同的训练体验。
登录后查看全文
热门项目推荐
相关项目推荐
Kimi-K2.5Kimi K2.5 是一款开源的原生多模态智能体模型,它在 Kimi-K2-Base 的基础上,通过对约 15 万亿混合视觉和文本 tokens 进行持续预训练构建而成。该模型将视觉与语言理解、高级智能体能力、即时模式与思考模式,以及对话式与智能体范式无缝融合。Python00
PaddleOCR-VL-1.5PaddleOCR-VL-1.5 是 PaddleOCR-VL 的新一代进阶模型,在 OmniDocBench v1.5 上实现了 94.5% 的全新 state-of-the-art 准确率。 为了严格评估模型在真实物理畸变下的鲁棒性——包括扫描伪影、倾斜、扭曲、屏幕拍摄和光照变化——我们提出了 Real5-OmniDocBench 基准测试集。实验结果表明,该增强模型在新构建的基准测试集上达到了 SOTA 性能。此外,我们通过整合印章识别和文本检测识别(text spotting)任务扩展了模型的能力,同时保持 0.9B 的超紧凑 VLM 规模,具备高效率特性。Python00
xw-cli实现国产算力大模型零门槛部署,一键跑通 Qwen、GLM-4.7、Minimax-2.1、DeepSeek-OCR 等模型Go06
yuanrongopenYuanrong runtime:openYuanrong 多语言运行时提供函数分布式编程,支持 Python、Java、C++ 语言,实现类单机编程高性能分布式运行。Go051
pc-uishopTNT开源商城系统使用java语言开发,基于SpringBoot架构体系构建的一套b2b2c商城,商城是满足集平台自营和多商户入驻于一体的多商户运营服务系统。包含PC 端、手机端(H5\APP\小程序),系统架构以及实现案例中应满足和未来可能出现的业务系统进行对接。Vue00
ebook-to-mindmapepub、pdf 拆书 AI 总结TSX01
项目优选
收起
deepin linux kernel
C
27
11
OpenHarmony documentation | OpenHarmony开发者文档
Dockerfile
540
3.77 K
Ascend Extension for PyTorch
Python
351
417
本项目是CANN提供的数学类基础计算算子库,实现网络在NPU上加速计算。
C++
889
614
openEuler内核是openEuler操作系统的核心,既是系统性能与稳定性的基石,也是连接处理器、设备与服务的桥梁。
C
338
185
openJiuwen agent-studio提供零码、低码可视化开发和工作流编排,模型、知识库、插件等各资源管理能力
TSX
988
253
openGauss kernel ~ openGauss is an open source relational database management system
C++
169
233
暂无简介
Dart
778
193
华为昇腾面向大规模分布式训练的多模态大模型套件,支撑多模态生成、多模态理解。
Python
115
141
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
1.35 K
758