BIRADS_classifier 项目使用教程

2024-09-18 15:15:40作者：平淮齐Percy

1. 项目介绍

BIRADS_classifier 是一个用于 BI-RADS 分类的高分辨率乳腺癌筛查模型。该项目基于多视角深度卷积神经网络，旨在通过分析标准筛查乳腺X光片（包括四个视角：L-CC, L-MLO, R-CC, R-MLO）来预测乳腺癌的风险等级。模型实现了在 TensorFlow 和 PyTorch 中的实现，并提供了预训练模型供用户直接使用。

2. 项目快速启动

2.1 环境准备

在开始之前，请确保您的环境中已经安装了以下依赖：

Python 3.6
TensorFlow 1.5.0 或 PyTorch 0.4.0
NumPy 1.14.3
SciPy 1.0.0
Pillow 5.1.0

2.2 克隆项目

首先，克隆项目到本地：

git clone https://github.com/nyukat/BIRADS_classifier.git
cd BIRADS_classifier

2.3 运行示例代码

项目提供了 TensorFlow 和 PyTorch 版本的示例代码，您可以根据需要选择其中一个运行。

使用 TensorFlow

python birads_prediction_tf.py

使用 PyTorch

python birads_prediction_torch.py

运行上述命令后，模型将加载预训练权重，并对提供的示例图像进行预测，输出 BI-RADS 分类的概率。

3. 应用案例和最佳实践

3.1 应用案例

BIRADS_classifier 可以应用于乳腺癌筛查中心，帮助医生快速评估患者的乳腺X光片，提供初步的 BI-RADS 分类建议。通过自动化这一过程，可以提高筛查效率，减少人为误差。

3.2 最佳实践

数据预处理：确保输入图像的大小为 2600x2000 像素，并且已经按照四个视角（L-CC, L-MLO, R-CC, R-MLO）进行裁剪。
模型选择：根据您的需求选择 TensorFlow 或 PyTorch 版本，两者在性能和功能上基本一致。
模型优化：如果需要进一步优化模型，可以考虑使用更大的数据集进行重新训练，或者调整模型的超参数。

4. 典型生态项目

TensorFlow：BIRADS_classifier 的 TensorFlow 实现依赖于 TensorFlow 框架，TensorFlow 是一个广泛使用的深度学习框架，提供了丰富的工具和库。
PyTorch：PyTorch 版本的实现依赖于 PyTorch 框架，PyTorch 以其动态计算图和易用性受到广泛欢迎。
NumPy 和 SciPy：这些库用于数据处理和科学计算，是 Python 生态中不可或缺的部分。
Pillow：用于图像处理的库，提供了加载和处理图像的功能。

通过这些生态项目的支持，BIRADS_classifier 能够高效地进行乳腺癌筛查的 BI-RADS 分类任务。