BIRADS_classifier 项目使用教程
2024-09-18 19:45:17作者:平淮齐Percy
1. 项目介绍
BIRADS_classifier 是一个用于 BI-RADS 分类的高分辨率乳腺癌筛查模型。该项目基于多视角深度卷积神经网络,旨在通过分析标准筛查乳腺X光片(包括四个视角:L-CC, L-MLO, R-CC, R-MLO)来预测乳腺癌的风险等级。模型实现了在 TensorFlow 和 PyTorch 中的实现,并提供了预训练模型供用户直接使用。
2. 项目快速启动
2.1 环境准备
在开始之前,请确保您的环境中已经安装了以下依赖:
- Python 3.6
- TensorFlow 1.5.0 或 PyTorch 0.4.0
- NumPy 1.14.3
- SciPy 1.0.0
- Pillow 5.1.0
2.2 克隆项目
首先,克隆项目到本地:
git clone https://github.com/nyukat/BIRADS_classifier.git
cd BIRADS_classifier
2.3 运行示例代码
项目提供了 TensorFlow 和 PyTorch 版本的示例代码,您可以根据需要选择其中一个运行。
使用 TensorFlow
python birads_prediction_tf.py
使用 PyTorch
python birads_prediction_torch.py
运行上述命令后,模型将加载预训练权重,并对提供的示例图像进行预测,输出 BI-RADS 分类的概率。
3. 应用案例和最佳实践
3.1 应用案例
BIRADS_classifier 可以应用于乳腺癌筛查中心,帮助医生快速评估患者的乳腺X光片,提供初步的 BI-RADS 分类建议。通过自动化这一过程,可以提高筛查效率,减少人为误差。
3.2 最佳实践
- 数据预处理:确保输入图像的大小为 2600x2000 像素,并且已经按照四个视角(L-CC, L-MLO, R-CC, R-MLO)进行裁剪。
- 模型选择:根据您的需求选择 TensorFlow 或 PyTorch 版本,两者在性能和功能上基本一致。
- 模型优化:如果需要进一步优化模型,可以考虑使用更大的数据集进行重新训练,或者调整模型的超参数。
4. 典型生态项目
- TensorFlow:BIRADS_classifier 的 TensorFlow 实现依赖于 TensorFlow 框架,TensorFlow 是一个广泛使用的深度学习框架,提供了丰富的工具和库。
- PyTorch:PyTorch 版本的实现依赖于 PyTorch 框架,PyTorch 以其动态计算图和易用性受到广泛欢迎。
- NumPy 和 SciPy:这些库用于数据处理和科学计算,是 Python 生态中不可或缺的部分。
- Pillow:用于图像处理的库,提供了加载和处理图像的功能。
通过这些生态项目的支持,BIRADS_classifier 能够高效地进行乳腺癌筛查的 BI-RADS 分类任务。
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