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repaq 项目使用教程

2024-08-30 18:10:00作者:裘晴惠Vivianne
repaq
A fast lossless FASTQ compressor with ultra-high compression ratio

1. 项目的目录结构及介绍

repaq 项目的目录结构如下:

repaq/
├── Makefile
├── README.md
├── src/
│   ├── main.cpp
│   ├── compressor.cpp
│   ├── decompressor.cpp
│   └── ...
├── include/
│   ├── compressor.h
│   ├── decompressor.h
│   └── ...
└── test/
    ├── test_compress.cpp
    ├── test_decompress.cpp
    └── ...

目录介绍

  • Makefile: 用于编译项目的 Makefile 文件。
  • README.md: 项目说明文档。
  • src/: 包含项目的源代码文件。
    • main.cpp: 主程序入口文件。
    • compressor.cpp: 压缩功能实现文件。
    • decompressor.cpp: 解压缩功能实现文件。
  • include/: 包含项目的头文件。
    • compressor.h: 压缩功能头文件。
    • decompressor.h: 解压缩功能头文件。
  • test/: 包含项目的测试文件。
    • test_compress.cpp: 压缩功能测试文件。
    • test_decompress.cpp: 解压缩功能测试文件。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件是 src/main.cpp。该文件包含了程序的入口点,负责解析命令行参数并调用相应的压缩或解压缩功能。

主要功能

  • 解析命令行参数。
  • 根据参数调用压缩或解压缩函数。
  • 输出处理结果。

3. 项目的配置文件介绍

repaq 项目没有传统的配置文件,其配置主要通过命令行参数进行。以下是一些常用的命令行参数:

  • -c: 表示进行压缩操作。
  • -d: 表示进行解压缩操作。
  • -i: 输入文件路径。
  • -o: 输出文件路径。
  • -z: 压缩级别,范围为 1 到 9,默认值为 4。

示例

# 压缩文件
repaq -c -i input.fq -o output.rfq.xz

# 解压缩文件
repaq -d -i input.rfq.xz -o output.fq

通过这些命令行参数,用户可以灵活地配置 repaq 的行为。


以上是 repaq 项目的使用教程,希望对您有所帮助。

repaq
A fast lossless FASTQ compressor with ultra-high compression ratio
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