GUDHI/TDA-tutorial 项目使用指南

1. 项目目录结构及介绍

GUDHI/TDA-tutorial/
├── binder/
├── github/workflows/
├── datasets/
├── utils/
├── .gitignore
├── DTM_filtrations.py
├── LICENSE
├── README.Rmd
├── README.md
├── Tuto-GUDHI-Barycenters-of-persistence-diagrams.ipynb
├── Tuto-GUDHI-ConfRegions-PersDiag-datapoints.ipynb
├── Tuto-GUDHI-DTM-filtrations.ipynb
├── Tuto-GUDHI-Expected-persistence-diagrams.ipynb
├── Tuto-GUDHI-PyTorch-optimization.ipynb
├── Tuto-GUDHI-Quantization-of-persistence-diagrams.ipynb
├── Tuto-GUDHI-alpha-complex-visualization.ipynb
├── Tuto-GUDHI-cover-complex.ipynb
├── Tuto-GUDHI-cubical-complexes.ipynb
├── Tuto-GUDHI-extended-persistence.ipynb
├── Tuto-GUDHI-kPDTM-kPLM.ipynb
├── Tuto-GUDHI-optimization.ipynb
├── Tuto-GUDHI-persistence-diagrams.ipynb
├── Tuto-GUDHI-persistent-entropy.ipynb
├── Tuto-GUDHI-perslay-visu.ipynb
├── Tuto-GUDHI-representations.ipynb
├── Tuto-GUDHI-simplex-Trees.ipynb
├── Tuto-GUDHI-simplicial-complexes-from-data-points.ipynb
├── Tuto-GUDHI-simplicial-complexes-from-distance-matrix.ipynb
└── persistence_statistics.py

目录结构介绍

• binder/: 包含用于Binder服务的配置文件。
• github/workflows/: 包含GitHub Actions的工作流配置文件。
• datasets/: 包含项目使用的数据集。
• utils/: 包含项目使用的工具函数和脚本。
• .gitignore: Git忽略文件配置。
• DTM_filtrations.py: 处理DTM过滤的Python脚本。
• LICENSE: 项目许可证文件。
• README.Rmd: R Markdown格式的README文件。
• README.md: Markdown格式的README文件。
• Tuto-GUDHI-*.ipynb: 一系列Jupyter Notebook教程文件，涵盖了使用GUDHI库进行拓扑数据分析（TDA）的各种主题。
• persistence_statistics.py: 处理持久性统计的Python脚本。

2. 项目启动文件介绍

项目的主要启动文件是Jupyter Notebook文件，这些文件包含了使用GUDHI库进行拓扑数据分析的教程。以下是一些关键的启动文件：

• Tuto-GUDHI-persistence-diagrams.ipynb: 介绍如何计算持久性图和持久性条码。
• Tuto-GUDHI-simplex-Trees.ipynb: 介绍如何使用简单树数据结构进行拓扑数据分析。
• Tuto-GUDHI-alpha-complex-visualization.ipynb: 介绍如何可视化Alpha复形。

3. 项目的配置文件介绍

• .gitignore: 配置Git忽略的文件和目录。
• LICENSE: 项目的开源许可证配置。
• README.md: 项目的介绍和使用说明。
• binder/: 配置Binder服务的文件，用于在线运行Jupyter Notebook。
• github/workflows/: 配置GitHub Actions的工作流，用于自动化项目的CI/CD流程。

通过以上配置文件和启动文件，用户可以快速上手并深入学习使用GUDHI库进行拓扑数据分析。