Edlib 开源项目使用教程

1. 项目的目录结构及介绍

Edlib 是一个轻量级且超级快速的 C/C++ 库，用于使用编辑距离（Levenshtein 距离）进行序列比对。以下是 Edlib 项目的目录结构及其介绍：

edlib/
├── apps/
│   └── ...
├── bindings/
│   └── python/
│       └── ...
├── build/
│   └── ...
├── edlib/
│   ├── include/
│   │   └── edlib.h
│   └── src/
│       └── edlib.cpp
├── images/
│   └── ...
├── test/
│   └── ...
├── test_data/
│   └── ...
├── .gitignore
├── CMakeLists.txt
├── Dockerfile
├── Doxyfile
├── LICENSE
├── Makefile
├── README.md
└── appveyor.yml

目录结构介绍

• apps/: 包含一些示例应用程序，展示了如何使用 Edlib 库。
• bindings/python/: 包含 Python 绑定的源代码。
• build/: 构建生成的文件和二进制文件。
• edlib/: 包含 Edlib 库的核心源代码和头文件。
  • include/: 包含 Edlib 的头文件 edlib.h。
  • src/: 包含 Edlib 的源文件 edlib.cpp。
• images/: 包含项目相关的图片文件。
• test/: 包含测试代码和测试数据。
• test_data/: 包含用于测试的数据文件。
• .gitignore: Git 忽略文件配置。
• CMakeLists.txt: CMake 构建配置文件。
• Dockerfile: Docker 配置文件。
• Doxyfile: Doxygen 文档生成配置文件。
• LICENSE: 项目许可证文件。
• Makefile: 项目构建 Makefile。
• README.md: 项目介绍和使用说明。
• appveyor.yml: AppVeyor CI 配置文件。

2. 项目的启动文件介绍

Edlib 项目的启动文件主要是 edlib/src/edlib.cpp 和 edlib/include/edlib.h。这两个文件是 Edlib 库的核心实现和接口定义。

edlib.cpp

edlib.cpp 文件包含了 Edlib 库的主要实现代码，包括编辑距离计算、序列比对等功能。这个文件是 Edlib 库的核心，提供了所有必要的功能来计算两个序列之间的编辑距离。

edlib.h

edlib.h 文件是 Edlib 库的头文件，定义了库的接口和数据结构。用户在使用 Edlib 库时，需要包含这个头文件，并调用其中的函数来实现序列比对。

3. 项目的配置文件介绍

Edlib 项目的配置文件主要包括 CMakeLists.txt 和 Makefile。

CMakeLists.txt

CMakeLists.txt 是 CMake 构建系统的配置文件。它定义了项目的构建规则、依赖关系和目标文件。通过这个文件，用户可以使用 CMake 来生成项目的构建文件，并进行编译和安装。

Makefile

Makefile 是 GNU Make 构建系统的配置文件。它定义了项目的构建规则和目标。用户可以通过运行 make 命令来编译和构建项目。Makefile 还提供了一些常用的构建目标，如 make install 用于安装库文件。

总结

通过本教程，您应该对 Edlib 项目的目录结构、启动文件和配置文件有了基本的了解。这些知识将帮助您更好地理解和使用 Edlib 库进行序列比对。