【免费下载】 Rosetta和PyRosetta的安装与使用指南

本资源文件提供了关于Rosetta和PyRosetta的详细安装与使用指南。Rosetta是一款用于蛋白质结构预测和蛋白质设计的软件包，而PyRosetta是Rosetta的Python接口，允许用户使用Python语言调用Rosetta的功能。

内容概述

1. Rosetta的安装

   • 下载Rosetta
   • 安装和编译Rosetta
   • 配置环境变量

2. PyRosetta的安装

   • 下载PyRosetta
   • 解压安装
   • 配置Python环境

3. 使用教程

   • Rosetta的基本操作
   • PyRosetta的基本操作
   • 常见问题及解决方案

安装步骤

1. Rosetta的安装

下载Rosetta

• 从官方网站下载Rosetta软件包，需要学术账号和密码。
• 也可以通过百度网盘下载，密码为0hoe。

安装和编译Rosetta

• 安装依赖：OPENMPI、BOOST、Python2.7
• 编译Rosetta：使用gcc编译，命令为./scons py -j 4 mode=release bin extras=mpi

配置环境变量

• 编辑~/.bashrc文件，添加Rosetta的路径
• 使配置生效：source ~/.bashrc

2. PyRosetta的安装

下载PyRosetta

• 从官方网站下载PyRosetta软件包，密码为fe72。

解压安装

• 解压文件：tar -vjxf PyRosetta4_Debug_python27_ubuntu_release-185.tar.bz2
• 安装：sudo python setup.py install

3. 使用教程

Rosetta的基本操作

• 启动Rosetta并进行蛋白质结构预测
• 使用Rosetta进行蛋白质设计

PyRosetta的基本操作

• 在Python环境中导入PyRosetta模块
• 使用PyRosetta进行蛋白质结构预测和设计

常见问题及解决方案

• 安装过程中可能遇到的错误及解决方法
• 使用过程中常见问题的解决方案

总结

本资源文件详细介绍了Rosetta和PyRosetta的安装与使用方法，适合初学者和进阶用户参考。通过本指南，您可以顺利安装并开始使用Rosetta和PyRosetta进行蛋白质结构预测和设计。