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开源项目 Stability Selection 使用教程

2024-08-08 22:36:55作者:裴麒琰

1. 项目的目录结构及介绍

stability-selection/
├── examples/
│   ├── example_classification.py
│   ├── example_regression.py
│   └── ...
├── stability_selection/
│   ├── __init__.py
│   ├── stability_selection.py
│   └── ...
├── tests/
│   ├── test_stability_selection.py
│   └── ...
├── .gitignore
├── LICENSE
├── README.md
└── setup.py
  • examples/: 包含项目的示例代码,如分类和回归问题的示例。
  • stability_selection/: 包含项目的主要代码文件,如 stability_selection.py
  • tests/: 包含项目的测试代码。
  • .gitignore: 指定Git版本控制系统忽略的文件和目录。
  • LICENSE: 项目的许可证文件。
  • README.md: 项目的说明文档。
  • setup.py: 项目的安装脚本。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件通常是 examples/ 目录下的示例代码文件,例如 example_classification.pyexample_regression.py。这些文件展示了如何使用 stability-selection 库进行特征选择。

example_classification.py 为例:

from stability_selection import StabilitySelection
from sklearn.pipeline import Pipeline
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
import numpy as np

# 生成示例数据
X, y, important_betas = _generate_dummy_classification_data(n=500, k=5)

# 定义基础估计器
base_estimator = Pipeline([
    ('scaler', StandardScaler()),
    ('model', LogisticRegression(penalty='l1'))
])

# 实例化并运行稳定性选择
selector = StabilitySelection(base_estimator=base_estimator, lambda_name='model__C', lambda_grid=np.logspace(-5, -1, 50))
selector.fit(X, y)

print(selector.get_support(indices=True))

3. 项目的配置文件介绍

项目的主要配置文件是 setup.py,它用于安装和管理项目的依赖项。以下是 setup.py 的基本结构:

from setuptools import setup, find_packages

setup(
    name='stability-selection',
    version='0.1.0',
    packages=find_packages(),
    install_requires=[
        'numpy',
        'scikit-learn',
        # 其他依赖项
    ],
    author='Your Name',
    author_email='your.email@example.com',
    description='A Python implementation of the stability selection feature selection algorithm.',
    license='MIT',
    keywords='stability selection feature selection',
    url='https://github.com/scikit-learn-contrib/stability-selection',
)
  • name: 项目的名称。
  • version: 项目的版本号。
  • packages: 需要包含的包。
  • install_requires: 项目依赖的其他Python包。
  • author: 项目作者。
  • author_email: 作者的电子邮件地址。
  • description: 项目的简短描述。
  • license: 项目的许可证。
  • keywords: 项目的关键词。
  • url: 项目的GitHub地址。
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