在Scikit-learn中进行单位超球面聚类:von Mises-Fisher分布的魅力

项目介绍
本开源项目是基于Scikit-learn的一个扩展,专注于在单位超球面上的聚类算法。它实现了Banerjee等人在2005年发表于《Journal of Machine Learning Research》上的论文中提出的三种方法:“Clustering on the Unit Hypersphere using von Mises-Fisher Distributions”。这些算法旨在处理数据点位于高维空间表面(即单位超球面)的情况。
项目技术分析
项目包括以下算法:
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Spherical K-means(spkmeans) 它与常规的K-means算法类似,但在每个最大化步骤结束时将估计的聚类中心投影到单位球面上,保证了中心的规范化。
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Mixture of von Mises Fisher distributions(movMF) 这是一种以von Mises-Fisher分布为参数的混合模型,可以理解为具有“均值方向”和“浓度参数”的高维分布。movMF通过期望最大化(EM)算法来估计混合参数,实现数据的聚类。提供了“soft-movMF”和“hard-movMF”两种版本:
- soft-movMF 允许数据点对每个类别的归属概率有连续的估计,形成软聚类。
- hard-movMF 将每个示例的后验概率设置为其最可能类别的概率为1,其余类别为0,形成硬聚类。
项目及技术应用场景
这个项目非常适合那些数据点位于高维空间表面的场景,例如角度或方向数据。具体应用包括但不限于:
- 文档聚类,其中每个文档可以被视为一个词向量,且所有向量都已经被归一化到单位长度。
- 社交网络中的用户兴趣分析,用户的喜好可以用高维向量表示。
- 天文数据分析,如星星的位置或角速度测量。
项目特点
- 灵活性:支持不同类型的聚类策略,包括软聚类和硬聚类。
- 全面性:不仅估计聚类中心,还联合估计权重和浓度参数。
- 高效性:对于特定情况,spherical k-means是movMF算法的特例。
- 兼容性:与Scikit-learn接口一致,易于集成。
- 附加功能:提供从von Mises-Fisher分布采样的实用工具。
安装与使用
你可以通过克隆仓库并运行python setup.py install来安装项目,或者直接使用pip install spherecluster。然后,像使用Scikit-learn的标准estimator一样使用SphericalKMeans和VonMisesFisherMixture类。
该项目还包含了可执行的例子,展示如何在二维和三维的小规模混合分布上以及在文档聚类任务中使用这些算法。
在这个项目中,你可以找到对von Mises-Fisher分布的强大利用,使得在高维空间中的聚类任务变得更加精准和有效。如果你处理的数据集包含这样的特性,那么这个项目绝对值得尝试。
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