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Causal-Inference-and-Discovery-in-Python 项目教程

2024-09-14 07:45:09作者:龚格成

1. 项目介绍

Causal-Inference-and-Discovery-in-Python 是由 Packt Publishing 出版的一本关于因果推断和发现的 Python 书籍的代码库。该项目旨在帮助读者理解和应用现代因果机器学习技术,涵盖了从基础概念到高级算法的全面内容。通过使用 DoWhy、EconML、PyTorch 等工具,读者可以掌握因果推断的核心概念,并将其应用于实际问题中。

2. 项目快速启动

环境准备

首先,确保你已经安装了 Python 3.9 或更高版本。然后,使用以下命令安装项目所需的环境:

conda env create -f causal_book_py39_cuda117.yml

克隆项目

使用以下命令克隆项目到本地:

git clone https://github.com/PacktPublishing/Causal-Inference-and-Discovery-in-Python.git

运行示例代码

进入项目目录并运行示例代码:

cd Causal-Inference-and-Discovery-in-Python
jupyter notebook

打开 Jupyter Notebook 后,选择 Chapter_01.ipynb 文件,按照教程逐步运行代码。

3. 应用案例和最佳实践

案例1:因果效应估计

Chapter_04.ipynb 中,你将学习如何使用 DoWhy 库进行因果效应估计。以下是一个简单的示例代码:

from dowhy import CausalModel
import dowhy.datasets

# 生成模拟数据
data = dowhy.datasets.linear_dataset(
    beta=10,
    num_common_causes=5,
    num_instruments=2,
    num_samples=10000,
    treatment_is_binary=True)

# 定义因果模型
model = CausalModel(
    data=data["df"],
    treatment=data["treatment_name"],
    outcome=data["outcome_name"],
    common_causes=data["common_causes_names"])

# 识别因果效应
identified_estimand = model.identify_effect()

# 估计因果效应
estimate = model.estimate_effect(identified_estimand,
                                 method_name="backdoor.linear_regression")

print(estimate)

案例2:因果发现

Chapter_07.ipynb 中,你将学习如何使用 gCastle 库进行因果发现。以下是一个简单的示例代码:

from castle.algorithms import PC
from castle.datasets import IIDSimulation

# 生成模拟数据
data = IIDSimulation(n_nodes=10, n_edges=20, n_samples=1000)

# 运行因果发现算法
pc = PC()
pc.learn(data.X)

# 输出因果图
pc.causal_matrix

4. 典型生态项目

DoWhy

DoWhy 是一个用于因果推断的 Python 库,提供了从因果识别到估计的完整流程。它支持多种因果推断方法,如后门调整、前门调整和工具变量法。

EconML

EconML 是一个专注于因果机器学习的 Python 库,特别适用于处理大规模数据和复杂因果关系。它提供了多种因果效应估计方法,如双重稳健估计和双重机器学习。

PyTorch

PyTorch 是一个广泛使用的深度学习框架,本书中使用它来实现一些高级因果模型,如因果 BERT。

通过这些工具和项目的结合,读者可以深入理解因果推断的原理,并将其应用于实际问题中。

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