推荐文章:目标导向的分子图生成——Graph Convolutional Policy Network
2024-05-20 11:34:22作者:滕妙奇
在这个日益科学化的时代,化学合成和药物发现领域的自动化越来越受到重视。今天,我们要向您介绍一个开源项目——Graph Convolutional Policy Network for Goal-Directed Molecular Graph Generation,这是一个基于TensorFlow的框架,专门用于目标导向的分子结构生成。该项目由Stanford大学的研究人员开发,并在arXiv上发表。
1. 项目介绍
项目的核心是一个结合了图卷积网络(GCN)和强化学习(RL)的策略网络,旨在高效地生成满足特定目标属性的分子结构。通过模拟化学反应,它能够逐步构建复杂的分子图,从而实现对新药研发、材料设计等领域的创新性探索。
2. 技术分析
项目中的主要技术创新是Graph Convolutional Policy Network (GCN-Policy),这是一种融合了GCN和策略梯度算法PPO的模型。GCN负责从分子图中提取深度特征,而PPO则用于优化政策,以最大化期望的目标属性。这种结合使得模型不仅能理解和学习分子结构,还能智能地做出决策,生成满足目标的新型分子。
3. 应用场景
- 新药发现:通过生成具有特定药理活性或低毒性的分子结构,加速药物候选化合物的筛选。
- 材料科学:为新的功能材料设计提供可能的分子结构,如高性能聚合物、纳米复合材料等。
- 合成路线规划:自动设计最优的化学合成路径,提高实验室效率并减少资源浪费。
4. 项目特点
- 易用性:项目提供了详细的安装指南和简单的运行命令,支持单进程与多进程训练。
- 可视化监控:集成TensorBoard进行训练过程监控,便于调整参数和评估性能。
- 数据透明:所有生成的分子结构以SMILES字符串形式存储,并附带相应的目标属性评分,方便进一步研究。
如果您希望在化学合成领域探索人工智能的可能性,或者对目标导向的分子生成感兴趣,那么这个项目绝对值得尝试。只需按照项目提供的指引进行安装和运行,即可开启您的化学创新之旅!
# 开始您的化学创新之旅
- 安装依赖
- 调整`run_molecule.py`中的参数
- 单进程运行:`python run_molecule.py`
- 多进程运行:`mpirun -np 8 python run_molecule.py 2>/dev/null`
- 监控训练:`tensorboard --logdir runs`
让我们一起探索这个充满无限可能的化学世界!
登录后查看全文
热门项目推荐
Kimi-K2.5Kimi K2.5 是一款开源的原生多模态智能体模型,它在 Kimi-K2-Base 的基础上,通过对约 15 万亿混合视觉和文本 tokens 进行持续预训练构建而成。该模型将视觉与语言理解、高级智能体能力、即时模式与思考模式,以及对话式与智能体范式无缝融合。Python00- QQwen3-Coder-Next2026年2月4日,正式发布的Qwen3-Coder-Next,一款专为编码智能体和本地开发场景设计的开源语言模型。Python00
xw-cli实现国产算力大模型零门槛部署,一键跑通 Qwen、GLM-4.7、Minimax-2.1、DeepSeek-OCR 等模型Go06
PaddleOCR-VL-1.5PaddleOCR-VL-1.5 是 PaddleOCR-VL 的新一代进阶模型,在 OmniDocBench v1.5 上实现了 94.5% 的全新 state-of-the-art 准确率。 为了严格评估模型在真实物理畸变下的鲁棒性——包括扫描伪影、倾斜、扭曲、屏幕拍摄和光照变化——我们提出了 Real5-OmniDocBench 基准测试集。实验结果表明,该增强模型在新构建的基准测试集上达到了 SOTA 性能。此外,我们通过整合印章识别和文本检测识别(text spotting)任务扩展了模型的能力,同时保持 0.9B 的超紧凑 VLM 规模,具备高效率特性。Python00
Baichuan-M3-235BBaichuan-M3 是百川智能推出的新一代医疗增强型大型语言模型,是继 Baichuan-M2 之后的又一重要里程碑。Python00
VLOOKVLOOK™ 是优雅好用的 Typora/Markdown 主题包和增强插件。 VLOOK™ is an elegant and practical THEME PACKAGE × ENHANCEMENT PLUGIN for Typora/Markdown.Less00
热门内容推荐
最新内容推荐
Degrees of Lewdity中文汉化终极指南:零基础玩家必看的完整教程Unity游戏翻译神器:XUnity Auto Translator 完整使用指南PythonWin7终极指南:在Windows 7上轻松安装Python 3.9+终极macOS键盘定制指南:用Karabiner-Elements提升10倍效率Pandas数据分析实战指南:从零基础到数据处理高手 Qwen3-235B-FP8震撼升级:256K上下文+22B激活参数7步搞定机械键盘PCB设计:从零开始打造你的专属键盘终极WeMod专业版解锁指南:3步免费获取完整高级功能DeepSeek-R1-Distill-Qwen-32B技术揭秘:小模型如何实现大模型性能突破音频修复终极指南:让每一段受损声音重获新生
项目优选
收起
OpenHarmony documentation | OpenHarmony开发者文档
Dockerfile
539
3.76 K
Ascend Extension for PyTorch
Python
345
412
本项目是CANN提供的数学类基础计算算子库,实现网络在NPU上加速计算。
C++
888
605
openEuler内核是openEuler操作系统的核心,既是系统性能与稳定性的基石,也是连接处理器、设备与服务的桥梁。
C
337
182
暂无简介
Dart
777
192
deepin linux kernel
C
27
11
🎉 (RuoYi)官方仓库 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue3 & Vite、Element Plus 的前后端分离权限管理系统
Vue
1.34 K
758
React Native鸿蒙化仓库
JavaScript
303
356
openJiuwen agent-studio提供零码、低码可视化开发和工作流编排,模型、知识库、插件等各资源管理能力
TSX
987
252
仓颉编译器源码及 cjdb 调试工具。
C++
154
896