推荐文章:目标导向的分子图生成——Graph Convolutional Policy Network
2024-05-20 11:34:22作者:滕妙奇
在这个日益科学化的时代,化学合成和药物发现领域的自动化越来越受到重视。今天,我们要向您介绍一个开源项目——Graph Convolutional Policy Network for Goal-Directed Molecular Graph Generation,这是一个基于TensorFlow的框架,专门用于目标导向的分子结构生成。该项目由Stanford大学的研究人员开发,并在arXiv上发表。
1. 项目介绍
项目的核心是一个结合了图卷积网络(GCN)和强化学习(RL)的策略网络,旨在高效地生成满足特定目标属性的分子结构。通过模拟化学反应,它能够逐步构建复杂的分子图,从而实现对新药研发、材料设计等领域的创新性探索。
2. 技术分析
项目中的主要技术创新是Graph Convolutional Policy Network (GCN-Policy)
,这是一种融合了GCN和策略梯度算法PPO的模型。GCN负责从分子图中提取深度特征,而PPO则用于优化政策,以最大化期望的目标属性。这种结合使得模型不仅能理解和学习分子结构,还能智能地做出决策,生成满足目标的新型分子。
3. 应用场景
- 新药发现:通过生成具有特定药理活性或低毒性的分子结构,加速药物候选化合物的筛选。
- 材料科学:为新的功能材料设计提供可能的分子结构,如高性能聚合物、纳米复合材料等。
- 合成路线规划:自动设计最优的化学合成路径,提高实验室效率并减少资源浪费。
4. 项目特点
- 易用性:项目提供了详细的安装指南和简单的运行命令,支持单进程与多进程训练。
- 可视化监控:集成TensorBoard进行训练过程监控,便于调整参数和评估性能。
- 数据透明:所有生成的分子结构以SMILES字符串形式存储,并附带相应的目标属性评分,方便进一步研究。
如果您希望在化学合成领域探索人工智能的可能性,或者对目标导向的分子生成感兴趣,那么这个项目绝对值得尝试。只需按照项目提供的指引进行安装和运行,即可开启您的化学创新之旅!
# 开始您的化学创新之旅
- 安装依赖
- 调整`run_molecule.py`中的参数
- 单进程运行:`python run_molecule.py`
- 多进程运行:`mpirun -np 8 python run_molecule.py 2>/dev/null`
- 监控训练:`tensorboard --logdir runs`
让我们一起探索这个充满无限可能的化学世界!
热门项目推荐
鸿蒙开发工具大赶集
本仓将收集和展示鸿蒙开发工具,欢迎大家踊跃投稿。通过pr附上您的工具介绍和使用指南,并加上工具对应的链接,通过的工具将会成功上架到我们社区。012hertz
Go 微服务 HTTP 框架,具有高易用性、高性能、高扩展性等特点。Go01每日精选项目
🔥🔥 每日精选已经升级为:【行业动态】,快去首页看看吧,后续都在【首页 - 行业动态】内更新,多条更新哦~🔥🔥 每日推荐行业内最新、增长最快的项目,快速了解行业最新热门项目动态~~029kitex
Go 微服务 RPC 框架,具有高性能、强可扩展的特点。Go00Cangjie-Examples
本仓将收集和展示高质量的仓颉示例代码,欢迎大家投稿,让全世界看到您的妙趣设计,也让更多人通过您的编码理解和喜爱仓颉语言。Cangjie057毕方Talon工具
本工具是一个端到端的工具,用于项目的生成IR并自动进行缺陷检测。Python040PDFMathTranslate
PDF scientific paper translation with preserved formats - 基于 AI 完整保留排版的 PDF 文档全文双语翻译,支持 Google/DeepL/Ollama/OpenAI 等服务,提供 CLI/GUI/DockerPython06mybatis-plus
mybatis 增强工具包,简化 CRUD 操作。 文档 http://baomidou.com 低代码组件库 http://aizuda.comJava03国产编程语言蓝皮书
《国产编程语言蓝皮书》-编委会工作区018- DDeepSeek-R1探索新一代推理模型,DeepSeek-R1系列以大规模强化学习为基础,实现自主推理,表现卓越,推理行为强大且独特。开源共享,助力研究社区深入探索LLM推理能力,推动行业发展。【此简介由AI生成】Python00
热门内容推荐
最新内容推荐
项目优选
收起

Python - 100天从新手到大师
Python
609
115

本仓将收集和展示仓颉鸿蒙应用示例代码,欢迎大家投稿,在仓颉鸿蒙社区展现你的妙趣设计!
Cangjie
286
79

✍ WeChat Markdown Editor | 一款高度简洁的微信 Markdown 编辑器:支持 Markdown 语法、色盘取色、多图上传、一键下载文档、自定义 CSS 样式、一键重置等特性
Vue
111
25

旨在打造算法先进、性能卓越、高效敏捷、安全可靠的密码套件,通过轻量级、可剪裁的软件技术架构满足各行业不同场景的多样化要求,让密码技术应用更简单,同时探索后量子等先进算法创新实践,构建密码前沿技术底座!
C
60
48

🎉 基于Spring Boot、Spring Cloud & Alibaba、Vue3 & Vite、Element Plus的分布式前后端分离微服务架构权限管理系统
Vue
45
29

🦄🦄🦄AI赋能股票分析:自选股行情获取,成本盈亏展示,涨跌报警推送,市场整体/个股情绪分析,K线技术指标分析等。数据全部保留在本地。支持DeepSeek,OpenAI, Ollama,LMStudio,AnythingLLM,硅基流动,火山方舟,阿里云百炼等平台或模型。
Go
1
0

本仓将收集和展示高质量的仓颉示例代码,欢迎大家投稿,让全世界看到您的妙趣设计,也让更多人通过您的编码理解和喜爱仓颉语言。
Cangjie
205
57

前端智能化场景解决方案UI库,轻松构建你的AI应用,我们将持续完善更新,欢迎你的使用与建议。
官网地址:https://matechat.gitcode.com
184
34

🎉 基于SpringBoot,Spring Security,JWT,Vue & Element 的前后端分离权限管理系统,同时提供了 Vue3 的版本
Java
182
44

这是一个人工生命试验项目,最终目标是创建“有自我意识表现”的模拟生命体。
Java
8
0