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乳腺癌风险预测开源项目指南

2024-09-08 17:46:04作者:薛曦旖Francesca

欢迎使用乳腺癌风险预测开源项目,本项目由 Jean-njoroge 开发,致力于通过机器学习方法分析乳腺癌发病风险。以下是该项目的核心组件与操作指南,帮助您快速上手。

1. 项目目录结构及介绍

Breast-cancer-risk-prediction/
├── data/                           # 数据存放目录,包括原始数据和预处理后的数据集。
│   ├── raw_data.csv                # 原始数据文件
│   └── processed_data.csv          # 处理后的数据文件
├── src/                            # 源代码目录
│   ├── features.py                  # 特征工程相关函数
│   ├── model_train.py               # 模型训练脚本
│   ├── predict.py                   # 预测新数据脚本
│   └── utils.py                     # 辅助工具函数集合
├── notebooks/                      # Jupyter Notebook文件,用于数据分析和模型探索。
│   └── analysis.ipynb              # 分析示例或说明
├── requirements.txt                # 项目所需依赖库列表
└── README.md                       # 项目说明文件

2. 项目的启动文件介绍

主要的启动文件位于 src/ 目录下:

  • model_train.py: 此脚本负责加载数据、执行特征选择、切分训练测试集,并训练模型。完成训练后,它通常会保存模型以供后续使用。

  • predict.py: 使用训练好的模型进行预测。您需要提供特定的输入或者调用已知的数据集来进行预测。

如果您是从零开始,建议首先运行 model_train.py 来训练模型,之后可以利用 predict.py 进行实际的风险评估。

3. 项目的配置文件介绍

此项目未明确指定传统的配置文件(如 .ini, .yaml 文件),但关键配置和参数通常嵌入在源代码中,尤其是 features.pymodel_train.py 中。例如,数据路径、模型类型、超参数等可能直接作为变量定义在这些脚本里。要调整这些设置,您可以直接编辑相应的Python脚本中的相关变量。

注意事项

  • 在运行前,请确保安装了所有依赖项,可以通过运行 pip install -r requirements.txt 来自动安装。
  • 确保您的环境支持所依赖的所有库版本。
  • 根据具体需求调整数据路径,以保证能够正确读取数据文件。

此指南旨在提供一个快速入门框架,深入了解项目细节时,请参考项目的 README.md 文件和内部代码注释。

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